116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0737 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  55.44 
 
 
1014 aa  1078    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  100 
 
 
991 aa  2024    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.8 
 
 
1122 aa  352  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.37 
 
 
1122 aa  350  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  28.56 
 
 
1069 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  28.27 
 
 
1067 aa  288  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  29.16 
 
 
1014 aa  281  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  32.64 
 
 
1581 aa  273  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.86 
 
 
1030 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  31.8 
 
 
1470 aa  254  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.2 
 
 
1181 aa  250  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  34.5 
 
 
1544 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  30.96 
 
 
1169 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.94 
 
 
1155 aa  243  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  32.44 
 
 
1215 aa  238  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  32.44 
 
 
1228 aa  238  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  31 
 
 
1169 aa  238  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.44 
 
 
1115 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  32.29 
 
 
1214 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  32.29 
 
 
1225 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.08 
 
 
1223 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.27 
 
 
1245 aa  231  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  28.27 
 
 
1200 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.66 
 
 
1227 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  31.96 
 
 
1521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.81 
 
 
1158 aa  218  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  29.77 
 
 
1174 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  31.31 
 
 
1521 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.61 
 
 
1056 aa  197  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  29.73 
 
 
1545 aa  197  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  29.34 
 
 
1493 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  28.55 
 
 
1309 aa  195  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.71 
 
 
1223 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.62 
 
 
1148 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 
1378 aa  190  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.71 
 
 
1223 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.71 
 
 
1223 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  28.84 
 
 
1378 aa  190  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.8 
 
 
1500 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.16 
 
 
1169 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.97 
 
 
1168 aa  187  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  31.82 
 
 
1323 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.87 
 
 
1168 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.76 
 
 
1168 aa  184  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.76 
 
 
1168 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.17 
 
 
1186 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.63 
 
 
1168 aa  181  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.59 
 
 
1517 aa  177  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.11 
 
 
1204 aa  171  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.04 
 
 
1177 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  29.89 
 
 
1273 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  28.93 
 
 
1361 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.99 
 
 
1287 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.21 
 
 
1717 aa  164  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  25.86 
 
 
1254 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.24 
 
 
1148 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.69 
 
 
1577 aa  159  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  28.46 
 
 
1182 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.06 
 
 
1212 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.53 
 
 
1658 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.1 
 
 
1190 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.69 
 
 
1182 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  27.62 
 
 
1327 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.91 
 
 
1154 aa  150  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.5 
 
 
1676 aa  146  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.92 
 
 
1205 aa  146  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  26.04 
 
 
1895 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.62 
 
 
1191 aa  141  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.89 
 
 
1299 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.3 
 
 
1488 aa  138  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.87 
 
 
1204 aa  132  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.55 
 
 
1627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.74 
 
 
1296 aa  129  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  26.8 
 
 
798 aa  128  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.06 
 
 
1288 aa  127  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  28.63 
 
 
613 aa  127  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  27.3 
 
 
1127 aa  125  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  27.93 
 
 
1111 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.26 
 
 
1669 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.53 
 
 
1482 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.34 
 
 
1590 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  25.97 
 
 
596 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.52 
 
 
1686 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.27 
 
 
1946 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.72 
 
 
1355 aa  115  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.64 
 
 
1165 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  24.69 
 
 
1364 aa  112  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  29.63 
 
 
1132 aa  111  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.8 
 
 
1216 aa  109  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  24.91 
 
 
1714 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.42 
 
 
1281 aa  108  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.1 
 
 
1218 aa  108  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.37 
 
 
1201 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.96 
 
 
1270 aa  104  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  24.72 
 
 
611 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.51 
 
 
1568 aa  102  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  27.2 
 
 
1078 aa  99.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.89 
 
 
1194 aa  95.9  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  25.24 
 
 
1070 aa  95.1  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  30.28 
 
 
596 aa  93.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>