46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0779 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0779  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein transmembrane  100 
 
 		 611 aa  1209    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2685  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein transmembrane  40.1 
 
 		 604 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.687504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  30.52 
 
 		 613 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1014 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  24.72 
 
 		 991 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 		 1378 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  28.77 
 
 		 1378 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.5 
 
 		 1158 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1169 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25 
 
 		 1122 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.07 
 
 		 1155 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1169 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25 
 
 		 1122 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.46 
 
 		 1500 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.81 
 
 		 1517 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.58 
 
 		 1181 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.22 
 
 		 1544 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  25.38 
 
 		 1323 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.74 
 
 		 1223 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  26.01 
 
 		 1225 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  25.92 
 
 		 1214 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  24.74 
 
 		 1581 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  25.42 
 
 		 1228 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  25.05 
 
 		 1470 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  25.33 
 
 		 1215 aa  67.8  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.57 
 
 		 1577 aa  67  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.8 
 
 		 1154 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.89 
 
 		 1115 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.64 
 
 		 1245 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  28.16 
 
 		 798 aa  61.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  26 
 
 		 1182 aa  60.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25 
 
 		 1227 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.28 
 
 		 1676 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 		 1200 aa  57.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23.4 
 
 		 1361 aa  57.4  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.38 
 
 		 1205 aa  57  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  24.12 
 
 		 1174 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  22.73 
 
 		 1545 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.02 
 
 		 1658 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  22.92 
 
 		 1014 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.06 
 
 		 1309 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  27.14 
 
 		 1273 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.37 
 
 		 1288 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.08 
 
 		 1717 aa  47.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.57 
 
 		 1148 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  24.16 
 
 		 1327 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>