158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2345 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  45.83 
 
 
1895 aa  725    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  62.62 
 
 
1627 aa  2054    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.65 
 
 
1299 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.82 
 
 
1488 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.61 
 
 
1669 aa  1287    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.31 
 
 
1568 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 
1590 aa  3238    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.08 
 
 
1482 aa  991    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.75 
 
 
1686 aa  1320    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.63 
 
 
1288 aa  333  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.31 
 
 
1296 aa  307  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.03 
 
 
1270 aa  288  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  27.18 
 
 
1714 aa  191  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  29.13 
 
 
1946 aa  168  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.09 
 
 
1281 aa  157  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  36.09 
 
 
651 aa  147  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.02 
 
 
1030 aa  139  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  36.78 
 
 
656 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.7 
 
 
1544 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  26.75 
 
 
1581 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  35.91 
 
 
595 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.65 
 
 
991 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  26.17 
 
 
1014 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26.92 
 
 
1309 aa  112  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  36.49 
 
 
663 aa  111  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  37.13 
 
 
4761 aa  111  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  25.4 
 
 
1225 aa  108  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  25.6 
 
 
1214 aa  108  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.01 
 
 
1181 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  25.11 
 
 
1493 aa  106  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  25.53 
 
 
1215 aa  106  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  25.36 
 
 
1228 aa  105  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  24.96 
 
 
1470 aa  100  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  38.39 
 
 
352 aa  99  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  25.35 
 
 
1521 aa  98.6  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  38.67 
 
 
486 aa  97.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  31.32 
 
 
648 aa  97.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  25.15 
 
 
1521 aa  97.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.26 
 
 
1245 aa  97.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  27.69 
 
 
1069 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.84 
 
 
693 aa  95.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  24.54 
 
 
1254 aa  92.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  24.83 
 
 
1273 aa  92  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  26.64 
 
 
1067 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.96 
 
 
1223 aa  88.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  32.39 
 
 
482 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  25.98 
 
 
1169 aa  86.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.75 
 
 
1227 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  24.95 
 
 
1169 aa  84.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 
1200 aa  84.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.55 
 
 
1115 aa  84  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.87 
 
 
1122 aa  82  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.94 
 
 
1223 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.42 
 
 
1056 aa  80.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.71 
 
 
1122 aa  79  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.38 
 
 
1762 aa  79  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  32.35 
 
 
692 aa  77.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  25.04 
 
 
1327 aa  77.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.9 
 
 
1155 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  23.58 
 
 
1174 aa  76.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.05 
 
 
1223 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.38 
 
 
1838 aa  72.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.05 
 
 
1223 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  30.8 
 
 
1026 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.06 
 
 
1177 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  25 
 
 
1148 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  31.34 
 
 
1182 aa  70.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.73 
 
 
2002 aa  68.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  25.43 
 
 
1378 aa  68.6  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  25.43 
 
 
1378 aa  68.6  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.74 
 
 
1500 aa  67.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.45 
 
 
3925 aa  67.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  40.8 
 
 
368 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.66 
 
 
1182 aa  67.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.04 
 
 
1194 aa  67.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.28 
 
 
1676 aa  66.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  26.64 
 
 
1014 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.72 
 
 
1165 aa  65.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.24 
 
 
1168 aa  65.1  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.92 
 
 
1722 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.82 
 
 
1158 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  27.53 
 
 
635 aa  65.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.42 
 
 
1168 aa  65.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.24 
 
 
1169 aa  64.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.92 
 
 
1723 aa  65.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.54 
 
 
1717 aa  64.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.14 
 
 
1658 aa  64.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  36.36 
 
 
1282 aa  63.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  30.59 
 
 
1627 aa  63.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  28.46 
 
 
1722 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  40.74 
 
 
685 aa  63.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  44.21 
 
 
665 aa  63.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  25 
 
 
596 aa  62.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  46.23 
 
 
1785 aa  62.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.24 
 
 
1168 aa  62.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.23 
 
 
14944 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  31.21 
 
 
798 aa  61.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.68 
 
 
1148 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.86 
 
 
2195 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.36 
 
 
1757 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>