73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1735 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  47.22 
 
 		 1051 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  38.08 
 
 		 1781 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  46.01 
 
 		 1785 aa  1229    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  54.72 
 
 		 824 aa  814    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  41.39 
 
 		 1282 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  41.69 
 
 		 1589 aa  1009    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  100 
 
 		 1627 aa  3278    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1838 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1752 aa  928    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  40.03 
 
 		 1744 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  42.28 
 
 		 2135 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  34.44 
 
 		 1389 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  43.96 
 
 		 1009 aa  328  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  37.16 
 
 		 1005 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  29.15 
 
 		 556 aa  181  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.64 
 
 		 509 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  43.15 
 
 		 1728 aa  155  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  50 
 
 		 631 aa  155  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.47 
 
 		 522 aa  153  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 		 2337 aa  149  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  28.75 
 
 		 565 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  28 
 
 		 528 aa  143  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.19 
 
 		 553 aa  132  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  27.8 
 
 		 542 aa  125  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.07 
 
 		 552 aa  118  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.23 
 
 		 514 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.93 
 
 		 584 aa  115  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  28.51 
 
 		 458 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  41.77 
 
 		 523 aa  112  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  38.92 
 
 		 430 aa  109  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  29.23 
 
 		 569 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  44.44 
 
 		 642 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  25.69 
 
 		 506 aa  98.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 559 aa  96.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1066 aa  94  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  45.37 
 
 		 119 aa  92.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.8 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.08 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  23.21 
 
 		 448 aa  73.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  25.66 
 
 		 547 aa  72  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.37 
 
 		 515 aa  71.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  26.83 
 
 		 628 aa  66.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  36.36 
 
 		 4761 aa  62.4  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.31 
 
 		 1590 aa  62  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  36.51 
 
 		 685 aa  58.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  25.78 
 
 		 595 aa  56.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.23 
 
 		 765 aa  56.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.79 
 
 		 1557 aa  55.5  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.62 
 
 		 546 aa  55.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.71 
 
 		 1627 aa  53.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.77 
 
 		 651 aa  53.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.87 
 
 		 1686 aa  53.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.11 
 
 		 1762 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  33.09 
 
 		 536 aa  50.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.03 
 
 		 757 aa  51.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.58 
 
 		 693 aa  50.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  37.39 
 
 		 352 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 		 2796 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3925 aa  49.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  35.92 
 
 		 1748 aa  49.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1933 aa  49.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1026 aa  49.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  43.66 
 
 		 2002 aa  49.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  24.89 
 
 		 4697 aa  48.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  23.32 
 
 		 773 aa  48.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  28.28 
 
 		 767 aa  47.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  36.59 
 
 		 2117 aa  47  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  34.23 
 
 		 368 aa  46.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  33.62 
 
 		 4379 aa  46.2  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.29 
 
 		 1757 aa  45.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.75 
 
 		 772 aa  45.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  35.92 
 
 		 555 aa  45.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.59 
 
 		 753 aa  45.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>