66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6496 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  54.37 
 
 
2337 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  54.76 
 
 
1785 aa  757    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  51.23 
 
 
1752 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  50.8 
 
 
1838 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  49.74 
 
 
1589 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  100 
 
 
1051 aa  2136    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  50.06 
 
 
1744 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  50.32 
 
 
1781 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  48.43 
 
 
2135 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  47.48 
 
 
1627 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  42.19 
 
 
1282 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  41.06 
 
 
1389 aa  522  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  66.87 
 
 
631 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  38.21 
 
 
1005 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.58 
 
 
556 aa  218  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  32.06 
 
 
509 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  54.97 
 
 
1728 aa  168  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  49.69 
 
 
1009 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  29.35 
 
 
522 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  28.35 
 
 
528 aa  145  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  28.51 
 
 
542 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  29.91 
 
 
514 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  42.86 
 
 
824 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29.39 
 
 
565 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  29.16 
 
 
569 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  27.77 
 
 
506 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.31 
 
 
552 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  47.1 
 
 
523 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.28 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  27.67 
 
 
584 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  32.32 
 
 
614 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  29.77 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.02 
 
 
1066 aa  115  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  39.43 
 
 
642 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  34.38 
 
 
430 aa  111  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.23 
 
 
503 aa  99.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.62 
 
 
559 aa  96.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  44.79 
 
 
119 aa  91.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.05 
 
 
448 aa  90.1  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  28.36 
 
 
628 aa  88.2  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.85 
 
 
547 aa  84.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  27.73 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.85 
 
 
515 aa  73.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  40.4 
 
 
2117 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  36.99 
 
 
1047 aa  57  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.74 
 
 
765 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  37.29 
 
 
491 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  33.09 
 
 
767 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.41 
 
 
414 aa  49.3  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  36.56 
 
 
426 aa  48.9  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.34 
 
 
1152 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.07 
 
 
434 aa  48.5  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  31.02 
 
 
4022 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  32.12 
 
 
2178 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  23.45 
 
 
670 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  35.87 
 
 
846 aa  47.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  20.56 
 
 
757 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.97 
 
 
400 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  30.48 
 
 
4009 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  21.74 
 
 
753 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  22.06 
 
 
717 aa  47  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  34.09 
 
 
412 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  32.68 
 
 
1053 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  20.91 
 
 
757 aa  45.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  21.49 
 
 
773 aa  45.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  34.01 
 
 
1051 aa  45.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>