44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5010 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  100 
 
 
628 aa  1244    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  45.16 
 
 
448 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  37.25 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  32.76 
 
 
503 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  30.65 
 
 
515 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.96 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  28.09 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  28.41 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  27.83 
 
 
546 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  28.86 
 
 
1005 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  26.3 
 
 
1589 aa  95.5  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  29.64 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  28.48 
 
 
1051 aa  93.6  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  27.87 
 
 
522 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.38 
 
 
565 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  27.18 
 
 
552 aa  87.4  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.1 
 
 
506 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  29.56 
 
 
1785 aa  84.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  28.8 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  24.18 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.73 
 
 
1781 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  27.69 
 
 
2135 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  26.64 
 
 
1627 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  27.23 
 
 
1752 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  29.75 
 
 
1838 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  31 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  26.71 
 
 
2337 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  26.15 
 
 
1728 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  24.49 
 
 
542 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  25.83 
 
 
514 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  26.85 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.16 
 
 
757 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  26.92 
 
 
458 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  27.64 
 
 
1744 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  37.5 
 
 
1282 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  31.82 
 
 
772 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  25 
 
 
584 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  34.57 
 
 
773 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.71 
 
 
753 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  37.14 
 
 
717 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  30 
 
 
705 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  31.09 
 
 
1389 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  37.14 
 
 
691 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  23.62 
 
 
670 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>