51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0778 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1046    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  46.11 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  48.15 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  39.83 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  39 
 
 		 556 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  31.53 
 
 		 1005 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  32 
 
 		 509 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  32.15 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  30.95 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.27 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  28 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1051 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1781 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1838 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1752 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  31.12 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 		 2337 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1785 aa  123  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 		 1728 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  28.37 
 
 		 553 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  29.13 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  28.05 
 
 		 2135 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  28.53 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  25.65 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.92 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1744 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1627 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  26.13 
 
 		 1389 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.81 
 
 		 546 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.5 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0779  hypothetical protein  31.89 
 
 		 191 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  27 
 
 		 1282 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  27.39 
 
 		 628 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.01 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  25.93 
 
 		 765 aa  80.1  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  45.35 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  22.42 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.4 
 
 		 765 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  24.23 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.98 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25 
 
 		 772 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  24.47 
 
 		 717 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  25.48 
 
 		 670 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  24.24 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  20.45 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.87 
 
 		 810 aa  57  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  22.82 
 
 		 705 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  22.76 
 
 		 810 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  23.56 
 
 		 691 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.07 
 
 		 753 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>