33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4029 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  54.28 
 
 
1627 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  100 
 
 
824 aa  1615    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  44.64 
 
 
1785 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  36.35 
 
 
1589 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.04 
 
 
1838 aa  350  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  33.94 
 
 
1752 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  43.47 
 
 
1282 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  33.62 
 
 
1781 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  42.97 
 
 
1009 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  37.19 
 
 
1744 aa  248  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  29.47 
 
 
1389 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  35.1 
 
 
2135 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  27.86 
 
 
1005 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  44.94 
 
 
631 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  45.28 
 
 
1051 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  42.79 
 
 
1728 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  42.99 
 
 
2337 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.91 
 
 
1066 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  39.24 
 
 
523 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  41.88 
 
 
642 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  36.09 
 
 
430 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  33.9 
 
 
119 aa  82.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  25.98 
 
 
595 aa  62.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.32 
 
 
651 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.92 
 
 
1627 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.3 
 
 
1590 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  36.79 
 
 
4761 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.57 
 
 
1762 aa  47.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33.06 
 
 
656 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.71 
 
 
693 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  34.48 
 
 
352 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.02 
 
 
685 aa  45.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  31.16 
 
 
536 aa  44.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>