73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3678 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  37.49 
 
 		 1785 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  39.35 
 
 		 1781 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  47.57 
 
 		 2337 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  38.88 
 
 		 1752 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  100 
 
 		 1389 aa  2782    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1744 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  46.41 
 
 		 1728 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1627 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  34.99 
 
 		 1589 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1282 aa  495  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.57 
 
 		 1838 aa  485  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  38.4 
 
 		 2135 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  30.3 
 
 		 1005 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  31.59 
 
 		 556 aa  188  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  31.25 
 
 		 522 aa  165  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  29.47 
 
 		 824 aa  156  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1009 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  32.8 
 
 		 509 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  29.41 
 
 		 528 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  28.31 
 
 		 542 aa  129  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  26.37 
 
 		 514 aa  125  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  32.42 
 
 		 552 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  28.6 
 
 		 565 aa  109  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.97 
 
 		 1421 aa  109  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  37.44 
 
 		 631 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  29.16 
 
 		 4723 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  28.52 
 
 		 553 aa  102  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  38.27 
 
 		 642 aa  95.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  26.13 
 
 		 506 aa  91.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  26.33 
 
 		 569 aa  91.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  41.13 
 
 		 430 aa  90.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1066 aa  87  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  33.01 
 
 		 614 aa  87.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  44.14 
 
 		 1727 aa  86.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  24.77 
 
 		 584 aa  84  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  46.3 
 
 		 1202 aa  84  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  50 
 
 		 1631 aa  82.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  27.95 
 
 		 458 aa  80.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  32.91 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.16 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  29.07 
 
 		 559 aa  73.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.73 
 
 		 5899 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  49.51 
 
 		 488 aa  72  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.57 
 
 		 503 aa  70.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.04 
 
 		 765 aa  67.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  44.36 
 
 		 4231 aa  66.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  23.76 
 
 		 448 aa  64.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  26.41 
 
 		 3391 aa  63.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  25.75 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  27.94 
 
 		 772 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.89 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  26.81 
 
 		 547 aa  60.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  41.51 
 
 		 1134 aa  60.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  25 
 
 		 777 aa  60.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  28.48 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  26.72 
 
 		 2890 aa  57.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  38.78 
 
 		 1323 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.19 
 
 		 8321 aa  56.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  24.71 
 
 		 765 aa  53.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  40.57 
 
 		 2074 aa  52.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.67 
 
 		 753 aa  52.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  36.14 
 
 		 119 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.53 
 
 		 757 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.54 
 
 		 2117 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  36.7 
 
 		 934 aa  48.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  24.49 
 
 		 757 aa  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.85 
 
 		 2251 aa  46.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  22.41 
 
 		 670 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  31.03 
 
 		 628 aa  46.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  27.85 
 
 		 717 aa  45.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  40.79 
 
 		 426 aa  45.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.39 
 
 		 810 aa  45.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>