165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6214 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  52.53 
 
 
2337 aa  861    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  84.97 
 
 
1781 aa  2918    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  46.38 
 
 
1838 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  50.95 
 
 
1051 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  51.04 
 
 
1744 aa  1053    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  40.75 
 
 
1589 aa  966    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  44.35 
 
 
1785 aa  1102    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  100 
 
 
1752 aa  3492    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  38.6 
 
 
1389 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  37.72 
 
 
1627 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  52.82 
 
 
1728 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.87 
 
 
1282 aa  632  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  44.62 
 
 
2135 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  33.51 
 
 
824 aa  320  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  37.69 
 
 
1005 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  42.45 
 
 
1009 aa  243  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  32.59 
 
 
556 aa  219  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  32.16 
 
 
509 aa  194  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  32.69 
 
 
522 aa  193  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.13 
 
 
1066 aa  189  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  51.9 
 
 
631 aa  157  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  28.29 
 
 
528 aa  154  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  29.04 
 
 
514 aa  151  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  28.39 
 
 
565 aa  148  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  28.48 
 
 
542 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  30.65 
 
 
553 aa  134  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.25 
 
 
506 aa  133  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  29.39 
 
 
569 aa  132  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  30.15 
 
 
1006 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  30.9 
 
 
552 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  43.31 
 
 
430 aa  124  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.29 
 
 
1597 aa  123  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  44.81 
 
 
523 aa  122  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  45.32 
 
 
642 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  26.2 
 
 
584 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  35.41 
 
 
614 aa  111  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  30.19 
 
 
4978 aa  107  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  30.79 
 
 
458 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.05 
 
 
503 aa  97.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.33 
 
 
559 aa  90.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.23 
 
 
5769 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  49.47 
 
 
1712 aa  88.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.89 
 
 
3927 aa  87  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.44 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.73 
 
 
4848 aa  86.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.97 
 
 
1512 aa  85.9  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  44.12 
 
 
119 aa  84.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  55.7 
 
 
16322 aa  82.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  47.52 
 
 
663 aa  82.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.19 
 
 
5745 aa  81.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.24 
 
 
547 aa  82  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.98 
 
 
2346 aa  80.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.58 
 
 
1236 aa  79.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  26.47 
 
 
628 aa  78.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.05 
 
 
1367 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  41.24 
 
 
982 aa  76.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 
850 aa  75.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  25.76 
 
 
2353 aa  75.5  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 
3363 aa  74.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  29.95 
 
 
515 aa  74.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  39.01 
 
 
653 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  40.74 
 
 
1538 aa  70.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.24 
 
 
3191 aa  70.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  27.03 
 
 
2767 aa  68.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.14 
 
 
994 aa  68.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  34.81 
 
 
1126 aa  67.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  38.46 
 
 
653 aa  67.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  41.18 
 
 
5444 aa  67  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  44.55 
 
 
1394 aa  66.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  42.16 
 
 
892 aa  65.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.95 
 
 
2377 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.18 
 
 
761 aa  64.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.84 
 
 
4122 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  44.21 
 
 
2816 aa  63.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  36.88 
 
 
653 aa  62.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27 
 
 
1269 aa  62.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.79 
 
 
1268 aa  62.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  31.34 
 
 
2178 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  47.52 
 
 
1502 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  26.65 
 
 
721 aa  60.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  40.21 
 
 
539 aa  60.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.07 
 
 
546 aa  60.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 
1884 aa  59.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.56 
 
 
1363 aa  60.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  41.11 
 
 
1518 aa  59.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 
2555 aa  59.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  42.5 
 
 
2117 aa  58.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.74 
 
 
2074 aa  58.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  40.65 
 
 
1022 aa  59.3  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  37.14 
 
 
1131 aa  58.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  39.13 
 
 
2476 aa  58.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  40.45 
 
 
1416 aa  58.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 
1287 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.99 
 
 
2503 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  39.8 
 
 
2522 aa  57  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.95 
 
 
3089 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  38.38 
 
 
2848 aa  57  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  41 
 
 
2027 aa  56.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  44.83 
 
 
1131 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  36.84 
 
 
1911 aa  56.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>