145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1642 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  100 
 
 		 1022 aa  2062    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  51.05 
 
 		 1027 aa  905    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  39.31 
 
 		 560 aa  315  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  38.22 
 
 		 594 aa  289  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  37.88 
 
 		 582 aa  279  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  35.29 
 
 		 653 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  35.08 
 
 		 653 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  34.12 
 
 		 653 aa  221  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.78 
 
 		 765 aa  121  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  27.95 
 
 		 801 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  36.68 
 
 		 1597 aa  91.3  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  28.99 
 
 		 1178 aa  88.2  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  45.54 
 
 		 721 aa  87.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.33 
 
 		 994 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  31.92 
 
 		 646 aa  80.5  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  40.82 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.33 
 
 		 850 aa  79.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  38.58 
 
 		 1367 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  48.39 
 
 		 1394 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  46.43 
 
 		 1502 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.54 
 
 		 761 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.22 
 
 		 4848 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.96 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  46.39 
 
 		 1215 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  46.39 
 
 		 1215 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  46.39 
 
 		 1215 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  34.97 
 
 		 663 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.62 
 
 		 2816 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.39 
 
 		 1215 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  46.39 
 
 		 1215 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  25.77 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  40.52 
 
 		 2476 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.75 
 
 		 2114 aa  71.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  30.92 
 
 		 1040 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1109  hypothetical protein  27.62 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  42.22 
 
 		 3544 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36.79 
 
 		 4978 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.82 
 
 		 3699 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.79 
 
 		 3699 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1006 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  42.7 
 
 		 2503 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.51 
 
 		 2346 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  36.97 
 
 		 1911 aa  67.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  45.24 
 
 		 1066 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  48.28 
 
 		 556 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.05 
 
 		 3816 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1538 aa  66.6  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  45.65 
 
 		 1287 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  46.75 
 
 		 5745 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.24 
 
 		 3089 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.32 
 
 		 846 aa  66.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1752 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.21 
 
 		 3191 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  38.46 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.3 
 
 		 1884 aa  65.9  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  40.45 
 
 		 2522 aa  64.7  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.97 
 
 		 4122 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  44.57 
 
 		 3477 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1126 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  41.98 
 
 		 1867 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 		 4896 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  35.78 
 
 		 2848 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 3363 aa  62.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  37.82 
 
 		 2839 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.88 
 
 		 2602 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  35.34 
 
 		 4748 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.17 
 
 		 8321 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  39.08 
 
 		 1363 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.96 
 
 		 1236 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  37.19 
 
 		 2670 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 16322 aa  61.6  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  39.09 
 
 		 3474 aa  61.6  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1781 aa  61.6  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1076 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  39.78 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  44.44 
 
 		 886 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  46.88 
 
 		 5444 aa  60.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1512 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  42.86 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  29.81 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  38.37 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  41.49 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 4220 aa  58.9  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  38.61 
 
 		 1268 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.37 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  36.9 
 
 		 2267 aa  58.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.81 
 
 		 1269 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  40.82 
 
 		 1131 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.13 
 
 		 1712 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.39 
 
 		 5769 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 		 982 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  38.2 
 
 		 1269 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  40.51 
 
 		 2153 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  30 
 
 		 1416 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  35.29 
 
 		 2715 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  41.05 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  37.21 
 
 		 891 aa  55.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  40 
 
 		 2051 aa  55.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  36.84 
 
 		 539 aa  55.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33107  predicted protein  25 
 
 		 507 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>