188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2665 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  91.6 
 
 		 1131 aa  2137    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  73.14 
 
 		 936 aa  1417    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  58.24 
 
 		 877 aa  968    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  91.87 
 
 		 1131 aa  2144    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  62.44 
 
 		 895 aa  1181    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  59.11 
 
 		 945 aa  1115    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 1131 aa  2325    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  26.48 
 
 		 760 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  28.31 
 
 		 603 aa  179  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  50.77 
 
 		 744 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  25.76 
 
 		 536 aa  148  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  57.41 
 
 		 743 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  58.02 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  23.87 
 
 		 536 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  24.08 
 
 		 677 aa  121  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  46.97 
 
 		 743 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  26.72 
 
 		 631 aa  118  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  57.41 
 
 		 755 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  25.87 
 
 		 676 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  23.3 
 
 		 625 aa  104  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  26.08 
 
 		 625 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.42 
 
 		 679 aa  97.8  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  22.34 
 
 		 512 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.5 
 
 		 528 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  27.33 
 
 		 647 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  24.46 
 
 		 698 aa  88.2  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  25.77 
 
 		 872 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.93 
 
 		 569 aa  87  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  24.06 
 
 		 647 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  22.79 
 
 		 708 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  27.85 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.96 
 
 		 523 aa  77.4  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.15 
 
 		 515 aa  76.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  23.65 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  32.57 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  22.55 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  23.6 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  23.47 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  24.66 
 
 		 799 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  22.56 
 
 		 798 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  25.55 
 
 		 508 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  24.03 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.27 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  23.26 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  22.18 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  24.8 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  35.25 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  24.35 
 
 		 798 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  23.11 
 
 		 533 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  37.24 
 
 		 1597 aa  67.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.05 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  22.62 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  23.7 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  23.38 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1781 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  25.45 
 
 		 628 aa  63.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  32.47 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.47 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.53 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.48 
 
 		 533 aa  62  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  30.25 
 
 		 492 aa  62  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.19 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  34.26 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  22.58 
 
 		 519 aa  60.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 994 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  36.92 
 
 		 1367 aa  61.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  43.59 
 
 		 2816 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  23.32 
 
 		 534 aa  60.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  39.32 
 
 		 3474 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.81 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1752 aa  59.7  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  44.9 
 
 		 1394 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  32.41 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.84 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.84 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  36.17 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 515 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  23.61 
 
 		 620 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  39.53 
 
 		 892 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  32.29 
 
 		 551 aa  57  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  35.48 
 
 		 488 aa  57  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.95 
 
 		 496 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  31.96 
 
 		 556 aa  55.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.23 
 
 		 493 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  35.23 
 
 		 493 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  31.48 
 
 		 510 aa  55.1  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  35.61 
 
 		 1363 aa  55.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.15 
 
 		 721 aa  54.7  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.74 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  27.84 
 
 		 519 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  41.9 
 
 		 3477 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.8 
 
 		 2114 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  25.75 
 
 		 643 aa  54.3  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.31 
 
 		 516 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.31 
 
 		 516 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.31 
 
 		 529 aa  53.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.31 
 
 		 516 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.31 
 
 		 516 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>