More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0139 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  72.43 
 
 
499 aa  672    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
492 aa  995    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  44.33 
 
 
464 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  46.08 
 
 
493 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  48.05 
 
 
493 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  38.09 
 
 
476 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.21 
 
 
579 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  41 
 
 
533 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  39.87 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  39.87 
 
 
536 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
586 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
536 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
536 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
536 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  40.13 
 
 
535 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 
591 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  32.18 
 
 
513 aa  276  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  32.67 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  30.66 
 
 
514 aa  271  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  39.64 
 
 
535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  39.46 
 
 
535 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  39.46 
 
 
535 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  35.2 
 
 
532 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  33 
 
 
522 aa  265  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  35.98 
 
 
494 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  39.68 
 
 
531 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  36.58 
 
 
515 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  37.77 
 
 
490 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  34.17 
 
 
515 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  35.56 
 
 
486 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  34.65 
 
 
496 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  33.2 
 
 
569 aa  226  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  37.36 
 
 
527 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  34.79 
 
 
539 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  34.58 
 
 
499 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 
483 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  35.08 
 
 
547 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.28 
 
 
536 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  34.17 
 
 
519 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  32.53 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.95 
 
 
506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  30.16 
 
 
538 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  34.5 
 
 
532 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  31.05 
 
 
515 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  32.72 
 
 
504 aa  194  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  34.18 
 
 
508 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  32.04 
 
 
516 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  33.63 
 
 
321 aa  191  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  30.89 
 
 
488 aa  190  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  35.24 
 
 
528 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  30.56 
 
 
551 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  28.43 
 
 
487 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  30.54 
 
 
512 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  30.63 
 
 
519 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 
505 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  43.48 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  30.24 
 
 
474 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  30.24 
 
 
474 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  30.24 
 
 
474 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  28.19 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  30.52 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  28.72 
 
 
534 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  28.72 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.32 
 
 
569 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  29.31 
 
 
470 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  29.22 
 
 
470 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  29.35 
 
 
471 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  29.22 
 
 
470 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  29.22 
 
 
470 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  29.22 
 
 
470 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  37.18 
 
 
516 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  37.1 
 
 
536 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  37.18 
 
 
516 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  28.13 
 
 
487 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  37.1 
 
 
536 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  37.1 
 
 
536 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  37.18 
 
 
516 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  37.18 
 
 
516 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  37.1 
 
 
536 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  37.1 
 
 
536 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  29.56 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  36.86 
 
 
516 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  28.51 
 
 
470 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  29.03 
 
 
470 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  36.77 
 
 
524 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  36.86 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  36.54 
 
 
529 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 
528 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  36.54 
 
 
529 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  29.5 
 
 
471 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  36.54 
 
 
529 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  35.48 
 
 
539 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  28.51 
 
 
471 aa  150  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>