More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4816 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 512 aa  1037    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  53.66 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  40.47 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  36.05 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  36.38 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  36.12 
 
 		 528 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  38.61 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  38.01 
 
 		 486 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  35.58 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  35.29 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  34.08 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  35.84 
 
 		 532 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  32.92 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  34.35 
 
 		 679 aa  243  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  36.5 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  34.8 
 
 		 499 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  33.47 
 
 		 536 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  34.45 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  31.24 
 
 		 551 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  33.76 
 
 		 506 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  32.97 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  31.57 
 
 		 625 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  31.7 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 		 519 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  31.81 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.05 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.05 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  32.08 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  31.51 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  33.7 
 
 		 523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  29.24 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  28.35 
 
 		 760 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.67 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  30.33 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  30.33 
 
 		 516 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  30.33 
 
 		 516 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  30.33 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  30.33 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.13 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.13 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.13 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.13 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  29.03 
 
 		 625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 		 591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  31.6 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  31.6 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 		 579 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.63 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  28.79 
 
 		 677 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.96 
 
 		 519 aa  177  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  28.57 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  32.6 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.61 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  31.69 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.98 
 
 		 643 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  31.75 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  30.4 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  36.49 
 
 		 570 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.46 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  28.41 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  36.23 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  31.97 
 
 		 603 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30.79 
 
 		 535 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  27.56 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  32.44 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  30.47 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  30.47 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  31.39 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  31.39 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  31.39 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.93 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  30.64 
 
 		 470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  31.14 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  31.86 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  28.57 
 
 		 470 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  29.48 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  31.4 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  31.2 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.34 
 
 		 628 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  29.93 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  29.93 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  29.93 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  28.4 
 
 		 698 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  24.75 
 
 		 513 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  33.88 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  33.88 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  33.88 
 
 		 533 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  30.69 
 
 		 539 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  32.4 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>