172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3381 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 628 aa  1281    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  32.73 
 
 		 620 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  30.33 
 
 		 708 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  30.21 
 
 		 625 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.96 
 
 		 536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  31.05 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  29.35 
 
 		 779 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.05 
 
 		 631 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  30.29 
 
 		 779 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.11 
 
 		 508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  30.06 
 
 		 798 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  28.41 
 
 		 798 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.23 
 
 		 799 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.7 
 
 		 523 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  30.21 
 
 		 679 aa  164  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  29.18 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  29.39 
 
 		 647 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  29.34 
 
 		 512 aa  161  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.47 
 
 		 490 aa  157  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  30.28 
 
 		 625 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  27.49 
 
 		 677 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  30.77 
 
 		 698 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  29.38 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  29.5 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.63 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  29.26 
 
 		 647 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  27.79 
 
 		 676 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.28 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.45 
 
 		 496 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  29.4 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  26.42 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  27.06 
 
 		 687 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.91 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  28.83 
 
 		 516 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.86 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 734 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.75 
 
 		 551 aa  120  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.15 
 
 		 532 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.76 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.99 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.99 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.98 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  27.11 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  25.56 
 
 		 760 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25.75 
 
 		 519 aa  112  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  26.44 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.44 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.64 
 
 		 519 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.25 
 
 		 536 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.25 
 
 		 536 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  26.95 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.5 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.55 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.55 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  25.33 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  25.33 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  25.33 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  25.33 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25.33 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  25.76 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.33 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  29.39 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  29.39 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  29.39 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  29.39 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  29.11 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  29.11 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.03 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.4 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.03 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  29.11 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  29.11 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 591 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  24.78 
 
 		 510 aa  102  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.88 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  28.85 
 
 		 661 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  28.62 
 
 		 570 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  31.58 
 
 		 542 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.48 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  30.2 
 
 		 470 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  33.5 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.19 
 
 		 535 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.19 
 
 		 535 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  32.52 
 
 		 524 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  33.5 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  23.32 
 
 		 538 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  29.91 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  28.57 
 
 		 474 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  29.91 
 
 		 470 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  29.91 
 
 		 470 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  29.91 
 
 		 470 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  33.01 
 
 		 533 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.27 
 
 		 533 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  28.25 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>