More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0487 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  79.66 
 
 
532 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 
586 aa  1174    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  98.48 
 
 
591 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  79.1 
 
 
535 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  88.4 
 
 
579 aa  923    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  78.29 
 
 
535 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  78.73 
 
 
531 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  78.29 
 
 
535 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  77.74 
 
 
535 aa  804    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1077    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1077    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  76.68 
 
 
533 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  99.44 
 
 
536 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  99.63 
 
 
536 aa  1073    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1077    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  39 
 
 
514 aa  403  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  41.67 
 
 
513 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  41.45 
 
 
513 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  41.89 
 
 
522 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  39.03 
 
 
492 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  38.92 
 
 
499 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  37.09 
 
 
464 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  38.79 
 
 
321 aa  248  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  38.77 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  37.39 
 
 
496 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 
515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  33.76 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.99 
 
 
486 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  31.9 
 
 
569 aa  210  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  33.11 
 
 
493 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  33.11 
 
 
493 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  33.56 
 
 
499 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  31.17 
 
 
519 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  31.74 
 
 
539 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  32.5 
 
 
516 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  32.34 
 
 
533 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  31.58 
 
 
524 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.99 
 
 
516 aa  193  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.99 
 
 
516 aa  193  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.99 
 
 
516 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.99 
 
 
516 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  32.15 
 
 
527 aa  193  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.99 
 
 
529 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.99 
 
 
529 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  33.69 
 
 
532 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  32.26 
 
 
533 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  32.27 
 
 
516 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.99 
 
 
529 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  31.99 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  32.14 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  30.13 
 
 
504 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  31.44 
 
 
476 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  30.22 
 
 
534 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  32.18 
 
 
519 aa  187  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  29.3 
 
 
534 aa  187  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.52 
 
 
551 aa  187  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.42 
 
 
536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  31.18 
 
 
512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.47 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.47 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  32.46 
 
 
547 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  31.57 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  30.85 
 
 
536 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  30.85 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  30.85 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  28.75 
 
 
533 aa  180  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  32.81 
 
 
532 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  30.33 
 
 
536 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  30.33 
 
 
536 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  29.25 
 
 
538 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  30 
 
 
505 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  32.51 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  30.02 
 
 
515 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  32.43 
 
 
528 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  30.87 
 
 
551 aa  170  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.46 
 
 
528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  29.2 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.85 
 
 
508 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 
539 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.18 
 
 
519 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.03 
 
 
456 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  33.9 
 
 
542 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  30.47 
 
 
483 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  35.42 
 
 
570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.14 
 
 
460 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 
461 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  28.85 
 
 
459 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  28.17 
 
 
468 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  26.72 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.83 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  27.83 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.64 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  29.08 
 
 
631 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  34.56 
 
 
556 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  27.89 
 
 
460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 
457 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.92 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  28.95 
 
 
487 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>