More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002070 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  91.52 
 
 		 460 aa  859    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  100 
 
 		 460 aa  954    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  56.24 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  47.53 
 
 		 463 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  47.31 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  45.67 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  47.48 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  45.36 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  44.95 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  44.61 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  44.4 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  47.75 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  44.83 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  44.4 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  43.07 
 
 		 466 aa  319  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  40.94 
 
 		 463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  40.24 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  41.06 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  35.43 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  33.41 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.22 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.22 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  30.8 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.95 
 
 		 466 aa  210  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  33.03 
 
 		 500 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  33.72 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.41 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.7 
 
 		 479 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  29.59 
 
 		 565 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  32.49 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 479 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.39 
 
 		 546 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.54 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.54 
 
 		 544 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.36 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.27 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.27 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  29.28 
 
 		 511 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  29.03 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  28.6 
 
 		 513 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  28.45 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.69 
 
 		 579 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  29.61 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.98 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  28.99 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  28.63 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  28.63 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 		 513 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 586 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 536 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 536 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 536 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.17 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  27.45 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.72 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  27.78 
 
 		 531 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 591 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.56 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.02 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  26.38 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  25.71 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.56 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.56 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 		 532 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.77 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.67 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.51 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.25 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  31.88 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.44 
 
 		 497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  33.07 
 
 		 640 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  25.51 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.12 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  34 
 
 		 546 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  34.02 
 
 		 554 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  34.02 
 
 		 554 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  34.47 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  27.11 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  26.33 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  33.71 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  29.45 
 
 		 664 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  35.27 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  33 
 
 		 549 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.29 
 
 		 504 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  33.21 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  34.04 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  35.62 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  33.17 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  35.62 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  33.17 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  36.99 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  36.17 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  31.1 
 
 		 630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  36.99 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  29.03 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>