More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1304 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  65.51 
 
 
514 aa  695    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  71.57 
 
 
513 aa  766    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  100 
 
 
522 aa  1080    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  70.79 
 
 
513 aa  759    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  74.84 
 
 
321 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  40.15 
 
 
533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.45 
 
 
579 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  39.93 
 
 
535 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  39.93 
 
 
535 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  39.63 
 
 
535 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  39.96 
 
 
531 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  42.54 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 
586 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  42.36 
 
 
536 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 
536 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  39.29 
 
 
532 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 
536 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  42.36 
 
 
536 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  42.36 
 
 
536 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.87 
 
 
591 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 
492 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  34.75 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  32.83 
 
 
494 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  32.34 
 
 
492 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  32.45 
 
 
493 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  32.6 
 
 
493 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  30.02 
 
 
476 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.76 
 
 
515 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 
506 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.79 
 
 
490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.46 
 
 
516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  38.41 
 
 
499 aa  193  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  28.72 
 
 
532 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  25.31 
 
 
536 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.4 
 
 
569 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.98 
 
 
496 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  30.67 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  27.79 
 
 
532 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.53 
 
 
505 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  30.72 
 
 
488 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  28.1 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.54 
 
 
486 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  28.7 
 
 
487 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.47 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.47 
 
 
516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.47 
 
 
516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.47 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.47 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.81 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.68 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  27.1 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  29.36 
 
 
510 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.61 
 
 
529 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.89 
 
 
528 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  26.96 
 
 
519 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.42 
 
 
529 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.42 
 
 
529 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  26.88 
 
 
499 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.1 
 
 
551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  26.06 
 
 
524 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.07 
 
 
519 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.69 
 
 
536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.69 
 
 
536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.49 
 
 
536 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.9 
 
 
536 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.9 
 
 
536 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.47 
 
 
515 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  28.54 
 
 
539 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  27.48 
 
 
519 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  27.81 
 
 
538 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  26.63 
 
 
508 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  29.01 
 
 
504 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.09 
 
 
547 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  25.51 
 
 
539 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.21 
 
 
460 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.16 
 
 
527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  27.67 
 
 
528 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.64 
 
 
533 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.88 
 
 
502 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.88 
 
 
502 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  26.18 
 
 
512 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.74 
 
 
463 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  26.34 
 
 
533 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.43 
 
 
533 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  27.69 
 
 
483 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.8 
 
 
460 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  25.28 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  26.38 
 
 
460 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.03 
 
 
456 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  27.23 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.84 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.94 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.94 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  27.16 
 
 
437 aa  140  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 
457 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.91 
 
 
551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  24.14 
 
 
456 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  26.32 
 
 
460 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.34 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.63 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>