More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0198 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 492 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  69.57 
 
 		 494 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  50.66 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  39.56 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  37.55 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  39.28 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  38.32 
 
 		 476 aa  279  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  38.61 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  36.86 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  39.45 
 
 		 533 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  30.41 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  37.91 
 
 		 531 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  39.06 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  39.06 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  37.91 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  38.39 
 
 		 532 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  39.17 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  34.85 
 
 		 483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  32.78 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  37.53 
 
 		 536 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  37.53 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 536 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  32.89 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  33.11 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  33.03 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  32.53 
 
 		 532 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  34.77 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  29.62 
 
 		 569 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.62 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  27.35 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  27.35 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  31.97 
 
 		 490 aa  183  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  30.48 
 
 		 578 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  27.36 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  32.37 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  32.63 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  30.44 
 
 		 532 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  30.32 
 
 		 596 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  33.14 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  30.16 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.49 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.23 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  30.97 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 534 aa  160  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.76 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.35 
 
 		 486 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  29.51 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  30.6 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  27.36 
 
 		 649 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  25.99 
 
 		 487 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  29.83 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.31 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.8 
 
 		 547 aa  147  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.58 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.58 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  27 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.58 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.39 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.39 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.39 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.02 
 
 		 529 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.02 
 
 		 529 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.39 
 
 		 516 aa  143  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  27.53 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  27.19 
 
 		 646 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  24.43 
 
 		 688 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.97 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  31.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.29 
 
 		 460 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.69 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.83 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  25.34 
 
 		 703 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  27.07 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  26.19 
 
 		 716 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.79 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 533 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.8 
 
 		 533 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.61 
 
 		 527 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30 
 
 		 528 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.55 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  26.8 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.31 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.31 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  29.11 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.9 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  25.32 
 
 		 725 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.9 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.9 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.57 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>