More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39690 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  67.83 
 
 
463 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  70.22 
 
 
468 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  71.15 
 
 
461 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  70.02 
 
 
457 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  70.46 
 
 
457 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  71.55 
 
 
460 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  70 
 
 
460 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  78.29 
 
 
456 aa  716    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  100 
 
 
456 aa  923    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  67.83 
 
 
463 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  70.37 
 
 
459 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  48.1 
 
 
437 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  46.97 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  45.67 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  43.04 
 
 
466 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  39.66 
 
 
463 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  38.72 
 
 
463 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  37.02 
 
 
470 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.51 
 
 
460 aa  269  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  34.21 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  32.06 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  34.84 
 
 
434 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  34.84 
 
 
434 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  32.48 
 
 
466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  32.7 
 
 
465 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.8 
 
 
500 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 
479 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  31.85 
 
 
478 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  34.29 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.1 
 
 
477 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 
527 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 
508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  26.76 
 
 
565 aa  180  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.65 
 
 
544 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27.97 
 
 
546 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.97 
 
 
546 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  34.2 
 
 
511 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.79 
 
 
554 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.38 
 
 
498 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.79 
 
 
554 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 
498 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.73 
 
 
549 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.73 
 
 
592 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  29.58 
 
 
551 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.62 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  32.11 
 
 
464 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.39 
 
 
489 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.96 
 
 
514 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.79 
 
 
508 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 
513 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
536 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
536 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
536 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  32.03 
 
 
536 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  32.03 
 
 
536 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30.33 
 
 
535 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  29.83 
 
 
504 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.89 
 
 
535 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.89 
 
 
535 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.8 
 
 
531 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.73 
 
 
513 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  26.05 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  33.04 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.9 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  29.61 
 
 
494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 
591 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.72 
 
 
521 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  30.33 
 
 
535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  27.31 
 
 
521 aa  146  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.98 
 
 
490 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 
579 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  26.05 
 
 
515 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  28.11 
 
 
518 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  28.11 
 
 
518 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.8 
 
 
522 aa  143  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.14 
 
 
532 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.49 
 
 
535 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  29.67 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  27.52 
 
 
521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.58 
 
 
533 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  31.56 
 
 
496 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28 
 
 
486 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.11 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  28.52 
 
 
551 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.27 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.13 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  27.61 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 
493 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 
493 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  31.48 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  30.48 
 
 
499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  31.78 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  29.05 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  36.82 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.32 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>