More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4517 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 547 aa  1125    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  49.73 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  40.65 
 
 		 645 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  40.48 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  39.84 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  39.6 
 
 		 496 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  39.96 
 
 		 551 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  36.13 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  34.45 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  34.46 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  36.32 
 
 		 570 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  30.99 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  30.99 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  30.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  30.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  30.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  30.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  30.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  30.78 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  30.78 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  33.47 
 
 		 569 aa  223  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  33.81 
 
 		 532 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  31.88 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  30.33 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  31.75 
 
 		 487 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  31.51 
 
 		 519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  31.37 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  32.43 
 
 		 499 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  31.91 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  32.09 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  30.35 
 
 		 533 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  31.51 
 
 		 512 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0595  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.75 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  30.7 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  30.02 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  30.71 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  30.71 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  30.57 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  33.05 
 
 		 535 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  33.91 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  33.91 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.74 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  33.18 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  32.75 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  33.41 
 
 		 531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  32.75 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  34.2 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.6 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  32.52 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  33.48 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  29.76 
 
 		 515 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 591 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  32.24 
 
 		 536 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  32.24 
 
 		 536 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  33.26 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  32.44 
 
 		 514 aa  181  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  33.55 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  42.99 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  29.17 
 
 		 538 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  30.13 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  30.11 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  29.42 
 
 		 679 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.72 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  28.6 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  40.54 
 
 		 533 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  40.54 
 
 		 533 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  38.4 
 
 		 556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  40.54 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  37.31 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  37.31 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  40.27 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  30.8 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  33.63 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  33.85 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  29.27 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  27.94 
 
 		 708 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  31.24 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  28.29 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  29.29 
 
 		 625 aa  150  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  30.6 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  29.65 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  29.41 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  30.58 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  29.41 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  29.41 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  29.75 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 		 515 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  29.96 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  30.04 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  31.39 
 
 		 539 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  28 
 
 		 625 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>