231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1405 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  56.48 
 
 
625 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  100 
 
 
677 aa  1368    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  58.13 
 
 
631 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  88.18 
 
 
676 aa  1167    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  55.68 
 
 
647 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  48.02 
 
 
706 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  46.86 
 
 
687 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  40.23 
 
 
840 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  42.29 
 
 
698 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  36.72 
 
 
1094 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  36.08 
 
 
625 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  35.9 
 
 
620 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  36.33 
 
 
523 aa  269  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  32.98 
 
 
708 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  30.1 
 
 
661 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
734 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.62 
 
 
515 aa  200  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.87 
 
 
508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  29 
 
 
779 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  32.14 
 
 
872 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.09 
 
 
536 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.17 
 
 
779 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  31.47 
 
 
679 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.79 
 
 
512 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  29.07 
 
 
647 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.7 
 
 
799 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  30.08 
 
 
528 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.85 
 
 
487 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  31.45 
 
 
798 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.04 
 
 
798 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.73 
 
 
496 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  27.48 
 
 
628 aa  162  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.58 
 
 
643 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 
490 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.29 
 
 
547 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.65 
 
 
527 aa  144  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.01 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.71 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.25 
 
 
569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  28.12 
 
 
536 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.83 
 
 
510 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  25.53 
 
 
895 aa  126  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  28.34 
 
 
516 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.97 
 
 
528 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  24.79 
 
 
1201 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  24.08 
 
 
1131 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.49 
 
 
506 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.94 
 
 
519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  26.13 
 
 
502 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  26.13 
 
 
502 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  26.99 
 
 
877 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  29.22 
 
 
499 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.99 
 
 
504 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  30 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  25.77 
 
 
488 aa  115  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  24.6 
 
 
1131 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  23.9 
 
 
1131 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  25.84 
 
 
534 aa  114  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.67 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  25.61 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  26.49 
 
 
519 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  25.35 
 
 
760 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  23.93 
 
 
538 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.78 
 
 
464 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  26.85 
 
 
505 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  24.94 
 
 
524 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  28.31 
 
 
575 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 
1272 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  26.05 
 
 
492 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  25 
 
 
551 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  25.06 
 
 
499 aa  102  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.61 
 
 
533 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.45 
 
 
535 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.67 
 
 
533 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.51 
 
 
603 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  24.61 
 
 
533 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  24.41 
 
 
533 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  24.57 
 
 
535 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  24.57 
 
 
535 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  28.44 
 
 
570 aa  97.8  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  22.78 
 
 
514 aa  97.8  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  24.41 
 
 
533 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  24.32 
 
 
535 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.72 
 
 
1363 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  21.55 
 
 
513 aa  90.9  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  26.1 
 
 
945 aa  90.9  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  28.5 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  28.5 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.28 
 
 
579 aa  90.5  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 
586 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.46 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  27.33 
 
 
1363 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  29.47 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.6 
 
 
542 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  26.7 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  29.47 
 
 
536 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  28.51 
 
 
645 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  26.7 
 
 
493 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>