171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2155 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 708 aa  1442    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  42.02 
 
 		 779 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  42.94 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  41.14 
 
 		 779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  39.8 
 
 		 872 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  41.03 
 
 		 798 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  40.4 
 
 		 798 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  40.38 
 
 		 799 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  38.27 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  36.74 
 
 		 698 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  35.33 
 
 		 647 aa  326  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  36.06 
 
 		 631 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  34.42 
 
 		 625 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  34.21 
 
 		 706 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  31.92 
 
 		 840 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  33.24 
 
 		 687 aa  297  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  35.79 
 
 		 523 aa  290  7e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  31.16 
 
 		 1094 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  30.48 
 
 		 625 aa  275  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  33.82 
 
 		 677 aa  270  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  32.91 
 
 		 661 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  34.39 
 
 		 676 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 734 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  30.87 
 
 		 628 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  29.58 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.85 
 
 		 643 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  26.57 
 
 		 515 aa  170  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  30.2 
 
 		 508 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  32.94 
 
 		 679 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  31.72 
 
 		 528 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 547 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.74 
 
 		 512 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.7 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  36.8 
 
 		 487 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  25.17 
 
 		 1272 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.83 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.43 
 
 		 506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.09 
 
 		 536 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  27.83 
 
 		 1430 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.76 
 
 		 569 aa  124  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.02 
 
 		 1380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  30.8 
 
 		 1363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.57 
 
 		 490 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  30.59 
 
 		 1363 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.88 
 
 		 499 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  35.17 
 
 		 502 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  35.17 
 
 		 502 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 		 516 aa  114  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.49 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  35.64 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  28.33 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  32.35 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  33.05 
 
 		 570 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 760 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  24.5 
 
 		 536 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  24.5 
 
 		 536 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.89 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  24.5 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  24.5 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  24.5 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  29.32 
 
 		 1201 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.94 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.63 
 
 		 1973 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  33.5 
 
 		 528 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.72 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.6 
 
 		 464 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.41 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  31.07 
 
 		 505 aa  98.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  23.23 
 
 		 534 aa  97.8  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.53 
 
 		 519 aa  97.1  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.34 
 
 		 519 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  23.15 
 
 		 536 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  23.15 
 
 		 536 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.99 
 
 		 586 aa  94  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.99 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.99 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  22.99 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.83 
 
 		 524 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.76 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.76 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  30.38 
 
 		 539 aa  90.1  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 529 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 529 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 529 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.29 
 
 		 504 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  35.86 
 
 		 470 aa  89  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 516 aa  89  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.53 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.68 
 
 		 579 aa  88.6  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.53 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.27 
 
 		 535 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  32.07 
 
 		 533 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  35.35 
 
 		 470 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.96 
 
 		 551 aa  87.4  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  33.97 
 
 		 510 aa  87.4  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  32.07 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  24.52 
 
 		 895 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  35.35 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>