161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4007 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  90.63 
 
 		 779 aa  1429    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  51.48 
 
 		 798 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 779 aa  1588    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  50.49 
 
 		 798 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  50.61 
 
 		 799 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  43.39 
 
 		 872 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  41.59 
 
 		 708 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  37.92 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  30.9 
 
 		 698 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  31.62 
 
 		 620 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  28.31 
 
 		 840 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.17 
 
 		 631 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.95 
 
 		 706 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.51 
 
 		 1094 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  30.07 
 
 		 625 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  26.78 
 
 		 687 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  30.23 
 
 		 661 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  30.38 
 
 		 647 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.07 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  28.17 
 
 		 677 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.35 
 
 		 628 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  31.36 
 
 		 625 aa  177  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 		 734 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  29.73 
 
 		 676 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.92 
 
 		 643 aa  163  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  38.27 
 
 		 536 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.66 
 
 		 679 aa  130  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.09 
 
 		 528 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  36.89 
 
 		 515 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  34.47 
 
 		 512 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  27.02 
 
 		 536 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  34.3 
 
 		 508 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.19 
 
 		 502 aa  111  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.19 
 
 		 502 aa  111  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  32.77 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  34.21 
 
 		 486 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.93 
 
 		 569 aa  104  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  24.6 
 
 		 1272 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  30.41 
 
 		 527 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.59 
 
 		 496 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  31.76 
 
 		 532 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  32.76 
 
 		 490 aa  97.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  25.9 
 
 		 1363 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  27.31 
 
 		 534 aa  96.3  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  30.92 
 
 		 519 aa  95.5  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  25.61 
 
 		 1363 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  27.08 
 
 		 534 aa  94.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  24.24 
 
 		 1380 aa  94.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.43 
 
 		 1201 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  33.15 
 
 		 470 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  32.96 
 
 		 470 aa  90.9  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  33.15 
 
 		 470 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  33.15 
 
 		 470 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  33.15 
 
 		 470 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  33.15 
 
 		 470 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  32.58 
 
 		 470 aa  90.5  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  29.79 
 
 		 542 aa  89.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  29.96 
 
 		 551 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  30.68 
 
 		 570 aa  88.2  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  23.52 
 
 		 524 aa  88.2  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  24.83 
 
 		 533 aa  87.8  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  88.2  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  88.2  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  27.8 
 
 		 760 aa  87.8  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  31.84 
 
 		 470 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.96 
 
 		 528 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 533 aa  87.4  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  29.41 
 
 		 556 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  28.82 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  24.82 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  23.65 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.64 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  32.89 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  27.93 
 
 		 1973 aa  84.7  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  30.73 
 
 		 645 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.79 
 
 		 505 aa  83.2  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  26.95 
 
 		 1601 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  23.2 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.24 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>