More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4005 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  100 
 
 
505 aa  1018    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  53.42 
 
 
499 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  54.1 
 
 
532 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  52.11 
 
 
516 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  48.33 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  47.52 
 
 
519 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  41.24 
 
 
569 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  38.29 
 
 
506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  37.36 
 
 
519 aa  289  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  36.01 
 
 
504 aa  289  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  37.39 
 
 
496 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  35.55 
 
 
512 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  35.28 
 
 
519 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  34.99 
 
 
538 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  34.43 
 
 
533 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  34.31 
 
 
510 aa  259  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  35.12 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  34.36 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  34.36 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  36.95 
 
 
490 aa  250  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  36.65 
 
 
487 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  34.07 
 
 
470 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  34.07 
 
 
470 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  34.07 
 
 
470 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  34.07 
 
 
470 aa  249  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  33.87 
 
 
470 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  33.87 
 
 
470 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  33.87 
 
 
470 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  33.87 
 
 
470 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  34.02 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  34.02 
 
 
533 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  34.02 
 
 
533 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  33.58 
 
 
536 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  34.56 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  34.56 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  34.56 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  34.56 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  34.56 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  34.11 
 
 
470 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  34.56 
 
 
529 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  34.56 
 
 
529 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  34.94 
 
 
471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  34.56 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  34.56 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  34.26 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  33.9 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  33.9 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  33.9 
 
 
470 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  35.53 
 
 
515 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  33.87 
 
 
524 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  33.61 
 
 
551 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  34.07 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  34.15 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  33.77 
 
 
508 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  34.49 
 
 
488 aa  234  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  33.4 
 
 
470 aa  233  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  32.35 
 
 
536 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  32.35 
 
 
536 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  32.35 
 
 
536 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  32.35 
 
 
536 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  34.39 
 
 
471 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  33.71 
 
 
471 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  33.33 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  33.33 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  46.84 
 
 
502 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  46.84 
 
 
502 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  33.33 
 
 
474 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  31.8 
 
 
528 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  33.18 
 
 
547 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  29.38 
 
 
542 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  38.01 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.53 
 
 
499 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  33.49 
 
 
492 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  40.38 
 
 
539 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.97 
 
 
513 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  29.62 
 
 
514 aa  183  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  28.89 
 
 
467 aa  182  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  28.51 
 
 
513 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.96 
 
 
536 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.96 
 
 
536 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  32.52 
 
 
464 aa  181  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  34.4 
 
 
556 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
586 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
536 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
536 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
536 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  38.01 
 
 
551 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  30.69 
 
 
533 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.88 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.26 
 
 
528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.17 
 
 
570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
579 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.52 
 
 
532 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  31.81 
 
 
493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  30.51 
 
 
536 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  31.52 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  29.02 
 
 
625 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.6 
 
 
523 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 
535 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>