More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0353 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  67.77 
 
 		 513 aa  731    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  100 
 
 		 514 aa  1063    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  65.51 
 
 		 522 aa  679    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  68.16 
 
 		 513 aa  733    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  71.56 
 
 		 321 aa  475  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  42.52 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  42.52 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.89 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  42.01 
 
 		 533 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  41.79 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  41.87 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  41.87 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  41.87 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  41.39 
 
 		 536 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  41.39 
 
 		 536 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 591 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.3 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  32.44 
 
 		 494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  32.16 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  32.16 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.79 
 
 		 506 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  31.56 
 
 		 488 aa  210  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.08 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.88 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.53 
 
 		 496 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  29.82 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  29.45 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  30.98 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  29.45 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  31.82 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  32.02 
 
 		 569 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  29.68 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  28.54 
 
 		 539 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.91 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  30.53 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  38.72 
 
 		 499 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  29.6 
 
 		 533 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  28.66 
 
 		 533 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  28.73 
 
 		 519 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  28.36 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  28.66 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  30.96 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.2 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  28.66 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  28.66 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  29.09 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  28.66 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  28.11 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  28.66 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  29.09 
 
 		 529 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  29.09 
 
 		 529 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  28.45 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  28.87 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 536 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  29.07 
 
 		 536 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  32.44 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  28.86 
 
 		 536 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.82 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  28.66 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  28.66 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  28.97 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  28.87 
 
 		 524 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.74 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.48 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  29.8 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.01 
 
 		 528 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.15 
 
 		 528 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.69 
 
 		 551 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  26.29 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.45 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  34.92 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  25.45 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  30.41 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.22 
 
 		 460 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.96 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  27.29 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.73 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.43 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.93 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  25.74 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.28 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.08 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  26.73 
 
 		 460 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  29.14 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  25.69 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  26.35 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  26.89 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  31.69 
 
 		 542 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  25.97 
 
 		 459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>