More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2154 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 515 aa  1051    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  58.06 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  49.72 
 
 		 532 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  46.33 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  34.75 
 
 		 464 aa  268  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  35.67 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  34.22 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  35.29 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  35.21 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.21 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 515 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 586 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  33.55 
 
 		 536 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  33.55 
 
 		 536 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  34.26 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  34.78 
 
 		 535 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 591 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 579 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  33.12 
 
 		 531 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  34.26 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  34.26 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 532 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  28.65 
 
 		 514 aa  192  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  29.57 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  29.57 
 
 		 513 aa  186  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  38.49 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  29.29 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  29.24 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  28.55 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.72 
 
 		 569 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.18 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  28.2 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  29.01 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  29.81 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.04 
 
 		 506 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  26.33 
 
 		 519 aa  147  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  31.91 
 
 		 321 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.18 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.68 
 
 		 569 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  29.3 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 		 516 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  29.35 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  26.51 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.96 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.85 
 
 		 534 aa  137  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  24.85 
 
 		 534 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.6 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.26 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.94 
 
 		 551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.01 
 
 		 487 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  24.74 
 
 		 636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.78 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  24.74 
 
 		 636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.78 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  28.93 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.3 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  26.91 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  25.92 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  26.59 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.56 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  25.56 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  25.56 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  25.56 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  25.56 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.4 
 
 		 528 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.15 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  25.09 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.09 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.37 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  26.01 
 
 		 529 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  25 
 
 		 625 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.22 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25.81 
 
 		 516 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.41 
 
 		 536 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.41 
 
 		 536 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  25.78 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  26.33 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  25.81 
 
 		 631 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.17 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  25.7 
 
 		 456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.18 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  28.44 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  25.17 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.79 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  26.1 
 
 		 679 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  23.21 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  27.41 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  24.8 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  28.12 
 
 		 536 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>