More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0289 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 476 aa  973    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  46.17 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  46.17 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  40.85 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  40.85 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.77 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  32.08 
 
 		 508 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  34.31 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  32.31 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  34.69 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  32.35 
 
 		 468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  32.41 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.01 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  36.79 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.92 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  30.8 
 
 		 460 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  34.94 
 
 		 479 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  35.16 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.06 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  33.54 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  33.33 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  31.92 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  30.44 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  33.79 
 
 		 498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  32.49 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  35.39 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.53 
 
 		 544 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  32.93 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.87 
 
 		 546 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 		 500 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.82 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.54 
 
 		 546 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.4 
 
 		 554 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.4 
 
 		 554 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.57 
 
 		 549 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.4 
 
 		 551 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.4 
 
 		 551 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.73 
 
 		 498 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.51 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.88 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.75 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  31.57 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  32.82 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.69 
 
 		 511 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  30.82 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  31.22 
 
 		 521 aa  170  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  31 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  30.72 
 
 		 536 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  26.83 
 
 		 568 aa  163  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  27.18 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  26.2 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  31.22 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.6 
 
 		 551 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  33.18 
 
 		 592 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.02 
 
 		 496 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.88 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  27.08 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  27.94 
 
 		 572 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  25.74 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  27.27 
 
 		 594 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  28.63 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.1 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.85 
 
 		 513 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  25.05 
 
 		 561 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  28.34 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.65 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.99 
 
 		 561 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  29.17 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  35.4 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  27.1 
 
 		 599 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  35.32 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.01 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.53 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  30.92 
 
 		 566 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.79 
 
 		 536 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.79 
 
 		 536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  28.79 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 586 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  31.32 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  27.86 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.79 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  29.29 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 579 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.68 
 
 		 532 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.96 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.96 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  25.71 
 
 		 803 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.84 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  32.7 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>