More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1696 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  55.99 
 
 
554 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
527 aa  1091    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  55.99 
 
 
554 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  56.1 
 
 
544 aa  627  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  54.99 
 
 
546 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  54.33 
 
 
549 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  54.14 
 
 
551 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  54.14 
 
 
551 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  54.63 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  53.78 
 
 
551 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1692  multicopper oxidase type 2  94.74 
 
 
221 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  44.91 
 
 
565 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  39.01 
 
 
576 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  35.14 
 
 
478 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  32.61 
 
 
592 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  34.85 
 
 
511 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.74 
 
 
477 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  30.57 
 
 
489 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  43.38 
 
 
317 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  42.44 
 
 
505 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  30.9 
 
 
536 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.62 
 
 
506 aa  213  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.45 
 
 
508 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.95 
 
 
476 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  31.69 
 
 
460 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.91 
 
 
464 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  32.99 
 
 
551 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.91 
 
 
464 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  30.56 
 
 
513 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  36.89 
 
 
457 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  31.25 
 
 
521 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  36.77 
 
 
330 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  39.56 
 
 
373 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  31.56 
 
 
521 aa  201  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  31 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  30.79 
 
 
518 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  29.28 
 
 
556 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  30.7 
 
 
521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  29.11 
 
 
504 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  34.17 
 
 
358 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  26.86 
 
 
594 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  28.92 
 
 
456 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  29.3 
 
 
504 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  34.42 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  36.45 
 
 
358 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.09 
 
 
460 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  27.44 
 
 
568 aa  183  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  27.92 
 
 
561 aa  183  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 
462 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 
630 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  35.04 
 
 
609 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.89 
 
 
460 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  28.05 
 
 
535 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  29.34 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  36.43 
 
 
640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.44 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
462 aa  181  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  30.08 
 
 
463 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 
457 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  34.03 
 
 
470 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.33 
 
 
457 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  33.68 
 
 
471 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 
431 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  32.64 
 
 
470 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  30.75 
 
 
431 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  27.27 
 
 
568 aa  177  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  29.94 
 
 
431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  32.99 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29.94 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  32.61 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  33.33 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  31.43 
 
 
488 aa  174  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  38.79 
 
 
359 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  32.29 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  30.15 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  29.94 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  29.94 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29.94 
 
 
431 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 
434 aa  173  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 
434 aa  173  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  29.85 
 
 
431 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  30.42 
 
 
452 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  30.79 
 
 
459 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  32.64 
 
 
477 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 
432 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 
432 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 
455 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 
455 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  31.25 
 
 
470 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  28.1 
 
 
460 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  28.01 
 
 
463 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  32.29 
 
 
484 aa  170  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  33.11 
 
 
364 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  32.48 
 
 
446 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  31.94 
 
 
463 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  29.28 
 
 
433 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>