More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2440 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  89.31 
 
 		 533 aa  914    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  77.8 
 
 		 586 aa  797    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 532 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  78.3 
 
 		 591 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  92.34 
 
 		 535 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  90.65 
 
 		 535 aa  943    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  84.4 
 
 		 579 aa  781    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  91.21 
 
 		 535 aa  949    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  95.11 
 
 		 531 aa  977    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  91.21 
 
 		 535 aa  949    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  77.8 
 
 		 536 aa  797    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  77.8 
 
 		 536 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  78.17 
 
 		 536 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  78.17 
 
 		 536 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  77.8 
 
 		 536 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  39.74 
 
 		 514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  40.89 
 
 		 513 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  40.71 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  40.22 
 
 		 522 aa  389  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  37.2 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  38.28 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  38.18 
 
 		 492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  41.52 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  37.74 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  36.32 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  34.25 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  35.05 
 
 		 496 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  36.92 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.33 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  34.5 
 
 		 532 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  33.26 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  32.52 
 
 		 569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.69 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  31.43 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  31.5 
 
 		 519 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  31.64 
 
 		 504 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32.63 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  31.37 
 
 		 516 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.78 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  32.35 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  29.36 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.57 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.57 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.57 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.57 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.57 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.57 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.57 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  31.57 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  30.74 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  31.91 
 
 		 524 aa  180  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  31.96 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  30.53 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  30.44 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  31.86 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  30.83 
 
 		 539 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.26 
 
 		 551 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.42 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  30.26 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  30.56 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  30.79 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  30.79 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  30.79 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  30.42 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  30.42 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.48 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.48 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  29.94 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  32.92 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  28.92 
 
 		 533 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  31.86 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  30.75 
 
 		 505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  30.56 
 
 		 551 aa  166  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.71 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  30.63 
 
 		 519 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  29.14 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  30.47 
 
 		 487 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  34.59 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  30.72 
 
 		 483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  36.61 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  30.87 
 
 		 539 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.36 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  29.04 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  29.04 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.99 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  27.89 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  27.29 
 
 		 468 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  27.29 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.66 
 
 		 570 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.29 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  30.7 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  26.94 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.75 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  30.7 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  30.7 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  30.7 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  26.42 
 
 		 460 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>