More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1031 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  97.39 
 
 		 468 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  79.74 
 
 		 457 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  70 
 
 		 456 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  80.17 
 
 		 457 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  83.22 
 
 		 460 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  93.71 
 
 		 461 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 460 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  71.52 
 
 		 456 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  96.96 
 
 		 459 aa  922    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  66.38 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  66.16 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  48 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  45.38 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  44.73 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  42.21 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  37.29 
 
 		 470 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  36.98 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.07 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  34.59 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.92 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.58 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.58 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.49 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  32.49 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 		 434 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 		 434 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  31.04 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.06 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.72 
 
 		 565 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  30.25 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.1 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  29.14 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.9 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.14 
 
 		 592 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  27.73 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.1 
 
 		 546 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  29.12 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  27.92 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.08 
 
 		 490 aa  147  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.23 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.58 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.05 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.82 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.45 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.45 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  26.64 
 
 		 531 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.47 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.39 
 
 		 513 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.89 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.89 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.23 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.92 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  26.42 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.54 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.77 
 
 		 591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.57 
 
 		 551 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.31 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  27.18 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.29 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25.84 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.95 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  26.97 
 
 		 521 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.82 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.95 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  27.22 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.36 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  25.98 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  25.43 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  24.53 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.27 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  32.93 
 
 		 505 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  40.64 
 
 		 545 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.81 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.82 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  22.64 
 
 		 463 aa  113  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.12 
 
 		 510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  40.58 
 
 		 546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  24.22 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  39.13 
 
 		 549 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  38.46 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  39.13 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  39.13 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  38.46 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  41.61 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>