More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0133 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  99.22 
 
 		 516 aa  1060    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  99.42 
 
 		 516 aa  1061    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  66.91 
 
 		 539 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  81.53 
 
 		 536 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  64.78 
 
 		 533 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  99.22 
 
 		 529 aa  1058    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  81.53 
 
 		 536 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  81.16 
 
 		 536 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  81.34 
 
 		 536 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  64.78 
 
 		 533 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  99.42 
 
 		 529 aa  1060    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  81.34 
 
 		 536 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  59.03 
 
 		 556 aa  646    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  99.22 
 
 		 529 aa  1058    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  64.97 
 
 		 533 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  99.42 
 
 		 516 aa  1061    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  81.3 
 
 		 524 aa  888    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  100 
 
 		 516 aa  1067    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  61.45 
 
 		 551 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  99.22 
 
 		 516 aa  1057    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  99.22 
 
 		 516 aa  1060    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  45.84 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  40.12 
 
 		 534 aa  340  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  40.12 
 
 		 534 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  39.55 
 
 		 533 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  39.72 
 
 		 569 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  36.02 
 
 		 506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  36.7 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  35.22 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  35.25 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  33.8 
 
 		 516 aa  268  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  35.51 
 
 		 488 aa  254  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  34.11 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  34.62 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  33.72 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  33.72 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  31.72 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  31.72 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  31.72 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  31.72 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  31.53 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  31.53 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  31.53 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  31.53 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  32.43 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  32.09 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  32.11 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  32.11 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  32.11 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  32.66 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  31.63 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  32.17 
 
 		 470 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  32.24 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  32.09 
 
 		 470 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  33.01 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  31.46 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  30.45 
 
 		 538 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  42.11 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  42.11 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  31.91 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.99 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.9 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  32.05 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  42.12 
 
 		 486 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  31.39 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  42.42 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  32.2 
 
 		 536 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  32.2 
 
 		 536 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  31.06 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  32.75 
 
 		 527 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  30.33 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 591 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 579 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.56 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  28.45 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.28 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  28.9 
 
 		 536 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.71 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  31.92 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  31.92 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.36 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  30.55 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  34.23 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  29.42 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 		 531 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  31.2 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.17 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  27.47 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  26.81 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.45 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  37 
 
 		 542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32 
 
 		 570 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  36.86 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  33.11 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  37.16 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 		 679 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>