216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0500 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  100 
 
 		 467 aa  964    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  43.28 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  41.83 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  41.15 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  40.55 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  40.34 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  40.64 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  40.34 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  41.49 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  39.87 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  39.87 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  39.66 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  39.23 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  39.23 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  39.23 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  39.23 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  39.02 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.77 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  31.11 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  31.19 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.55 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.55 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  41.7 
 
 		 506 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.9 
 
 		 516 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.5 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.99 
 
 		 505 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  28.6 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  34.45 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  34.45 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  34.45 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  35.57 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  35.57 
 
 		 533 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  34.23 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  34.23 
 
 		 516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  35.23 
 
 		 533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  33.89 
 
 		 516 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  33.89 
 
 		 516 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  33.89 
 
 		 516 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  33.89 
 
 		 516 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  33.89 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 556 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  33.22 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  33.22 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  33.56 
 
 		 536 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  35.5 
 
 		 569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  33.22 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  34.66 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  34.66 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.86 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  26.34 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  26.79 
 
 		 504 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.99 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  27.42 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  26.42 
 
 		 512 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  26.43 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  26.19 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  24.87 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  24.66 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  24.31 
 
 		 508 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.8 
 
 		 490 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  30.28 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  23.01 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  25 
 
 		 528 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  26.54 
 
 		 570 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  30.09 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  27.63 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  23.62 
 
 		 643 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  35.67 
 
 		 645 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  23.51 
 
 		 679 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.27 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.61 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  22.51 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.02 
 
 		 499 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.45 
 
 		 579 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  23.09 
 
 		 547 aa  90.5  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  22.73 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  23.97 
 
 		 760 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  22.45 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  22.45 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  23.5 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  24.91 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  22.11 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.11 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  24.17 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.18 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  26.61 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>