More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3609 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  69.72 
 
 
470 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  68.02 
 
 
470 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  73.23 
 
 
474 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  69.94 
 
 
470 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  68.87 
 
 
470 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  69.94 
 
 
470 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  74.2 
 
 
471 aa  745    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  75.21 
 
 
471 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  69.08 
 
 
470 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  69.72 
 
 
470 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  75.21 
 
 
471 aa  759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  68.44 
 
 
470 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  69.94 
 
 
470 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  73.23 
 
 
474 aa  731    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  68.87 
 
 
470 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  73.23 
 
 
474 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  69.72 
 
 
470 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  100 
 
 
470 aa  961    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  69.94 
 
 
470 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  68.87 
 
 
470 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  83.19 
 
 
470 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  69.72 
 
 
470 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  40.68 
 
 
467 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  38 
 
 
486 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  35.79 
 
 
499 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  37.92 
 
 
532 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  35.06 
 
 
502 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  35.06 
 
 
502 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  32.09 
 
 
516 aa  246  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.77 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.77 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.77 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  32.09 
 
 
516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.9 
 
 
516 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.9 
 
 
516 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.9 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.9 
 
 
516 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  35.1 
 
 
516 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  34.56 
 
 
506 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  31.41 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  33.13 
 
 
505 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  34.74 
 
 
519 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  32.48 
 
 
534 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  31.81 
 
 
533 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  32.25 
 
 
569 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  31.62 
 
 
533 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  29.53 
 
 
519 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  36.3 
 
 
551 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  38.51 
 
 
533 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  35.21 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  35.21 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  35.21 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  35.21 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  35.21 
 
 
536 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  32.54 
 
 
496 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  37.76 
 
 
556 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  39.52 
 
 
539 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.28 
 
 
536 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  29.82 
 
 
504 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  29.47 
 
 
519 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  29.65 
 
 
510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  40 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  39.2 
 
 
533 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.58 
 
 
538 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.17 
 
 
515 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  26.99 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  29.35 
 
 
512 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 
499 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.93 
 
 
490 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.13 
 
 
487 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.93 
 
 
528 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  31.18 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.04 
 
 
508 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.04 
 
 
547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.63 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.9 
 
 
528 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  34.65 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.48 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.46 
 
 
514 aa  126  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.79 
 
 
679 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.85 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.55 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.55 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
586 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.91 
 
 
591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.42 
 
 
513 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.42 
 
 
579 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.05 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  26.03 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  30.32 
 
 
570 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  27.13 
 
 
535 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.44 
 
 
532 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  26.98 
 
 
531 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.48 
 
 
535 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.48 
 
 
535 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  28.61 
 
 
620 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>