More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0334 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  70.02 
 
 		 470 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  70.02 
 
 		 470 aa  692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  95.54 
 
 		 471 aa  929    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  70.24 
 
 		 470 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  75.21 
 
 		 470 aa  743    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  70.24 
 
 		 470 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  70.24 
 
 		 470 aa  693    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  70 
 
 		 470 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  79.83 
 
 		 471 aa  790    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  68.72 
 
 		 470 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  78.46 
 
 		 470 aa  778    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  68.3 
 
 		 470 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  68.94 
 
 		 470 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  68.72 
 
 		 470 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  78.34 
 
 		 474 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  100 
 
 		 471 aa  957    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  68.72 
 
 		 470 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  70.02 
 
 		 470 aa  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  70.24 
 
 		 470 aa  693    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  78.34 
 
 		 474 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  70.02 
 
 		 470 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  78.77 
 
 		 474 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  41.15 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  39.78 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  38.17 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  38.17 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  36.27 
 
 		 506 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  33.26 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  35.31 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  33.05 
 
 		 534 aa  243  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  33.05 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  34.62 
 
 		 569 aa  236  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  35.78 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  31.91 
 
 		 516 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.4 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.71 
 
 		 516 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.71 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.71 
 
 		 516 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.71 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.71 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  34.39 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  33.11 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  30.64 
 
 		 524 aa  216  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  33.53 
 
 		 519 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  31.4 
 
 		 519 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  39.38 
 
 		 551 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  31.1 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  31.24 
 
 		 519 aa  200  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  39.04 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  38.38 
 
 		 533 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  38.38 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  38.05 
 
 		 533 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.01 
 
 		 536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  28.57 
 
 		 510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  31.44 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 536 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 536 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 536 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 536 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 536 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  41.3 
 
 		 539 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  29.55 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  27.29 
 
 		 538 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  32.44 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.52 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  29.12 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.69 
 
 		 515 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  31.42 
 
 		 528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.58 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.4 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  28.86 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  36.32 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.57 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  28.54 
 
 		 551 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.61 
 
 		 464 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  28.81 
 
 		 679 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  27.08 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.89 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  26.02 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  30.74 
 
 		 570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.73 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.49 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.7 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  27.69 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.47 
 
 		 535 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  35.61 
 
 		 645 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  27.79 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0595  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.39 
 
 		 521 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.39 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  26.98 
 
 		 536 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  27.53 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.98 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.82 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.82 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>