285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1178 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
575 aa  1133    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  33.22 
 
 
547 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  33.15 
 
 
528 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0595  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.94 
 
 
521 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  32.77 
 
 
496 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  32.85 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  35.06 
 
 
645 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.93 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  31.18 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.59 
 
 
542 aa  170  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.17 
 
 
570 aa  146  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.03 
 
 
519 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.76 
 
 
486 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  28.72 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  28.72 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 
516 aa  137  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  30.45 
 
 
499 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 
515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.47 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.83 
 
 
519 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  27.96 
 
 
508 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  27.33 
 
 
533 aa  127  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.17 
 
 
464 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.62 
 
 
519 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.16 
 
 
504 aa  124  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.87 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.79 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.71 
 
 
529 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.71 
 
 
529 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  25.71 
 
 
529 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  25.71 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  25.71 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.35 
 
 
569 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  25.71 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25.71 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  25.71 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.51 
 
 
516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  34.23 
 
 
556 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  25.54 
 
 
538 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.01 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  27.56 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  27.56 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.77 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.35 
 
 
506 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.59 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  25.59 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.9 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  28.29 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.05 
 
 
528 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.74 
 
 
535 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.17 
 
 
535 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.17 
 
 
535 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  25.86 
 
 
474 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  25.86 
 
 
474 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  28.31 
 
 
677 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  25.86 
 
 
474 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  27.16 
 
 
470 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  27.16 
 
 
470 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  27.16 
 
 
470 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  27.53 
 
 
471 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  27.16 
 
 
470 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  26.95 
 
 
470 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  26.95 
 
 
470 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  26.95 
 
 
470 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  26.95 
 
 
470 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  27.9 
 
 
535 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.04 
 
 
536 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.04 
 
 
536 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.04 
 
 
536 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.04 
 
 
536 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.04 
 
 
536 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  27.95 
 
 
492 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  29.46 
 
 
470 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  24.89 
 
 
487 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  27.43 
 
 
531 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.52 
 
 
533 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  29.46 
 
 
470 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  29.46 
 
 
470 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  29.46 
 
 
470 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  29.46 
 
 
470 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.64 
 
 
532 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 
579 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  26.77 
 
 
536 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.77 
 
 
536 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 
586 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.12 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 
536 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 
536 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 
536 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 
591 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  30.83 
 
 
470 aa  97.8  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  31.12 
 
 
470 aa  97.8  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  25.51 
 
 
493 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  31.67 
 
 
471 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  24.67 
 
 
510 aa  97.1  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.06 
 
 
625 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  26.01 
 
 
470 aa  97.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  29.69 
 
 
539 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  25.51 
 
 
493 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  26.73 
 
 
647 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>