More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4709 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 515 aa  1016    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  50.77 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  50.22 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.92 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  37.34 
 
 		 464 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  36.49 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  35.14 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  36.12 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  35.63 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  33.65 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  33.47 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  33.91 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  34.39 
 
 		 532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.55 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  29.23 
 
 		 514 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  28.66 
 
 		 513 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  28.81 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  34.77 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.86 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  34.82 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  28.99 
 
 		 522 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 535 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  29.74 
 
 		 578 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  35.14 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  35.38 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  33.89 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  33.89 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.89 
 
 		 586 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.89 
 
 		 536 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.89 
 
 		 536 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.89 
 
 		 536 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  32.44 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 579 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.73 
 
 		 591 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 490 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  26.96 
 
 		 536 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  28.26 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.84 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  28.88 
 
 		 631 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.52 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  29.73 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  28.38 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  26.94 
 
 		 582 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  28.57 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  28.38 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  28.38 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  28.38 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  30.13 
 
 		 476 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.84 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.84 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  28.04 
 
 		 516 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.42 
 
 		 528 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  26.89 
 
 		 515 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  27 
 
 		 321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.36 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.28 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  29.03 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  26.43 
 
 		 561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.7 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.2 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  26.36 
 
 		 716 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  26.03 
 
 		 596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  27.91 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  28.36 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.39 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  28.98 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.34 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  27.52 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.65 
 
 		 499 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  28.14 
 
 		 518 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 536 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 536 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  26.33 
 
 		 539 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 536 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.82 
 
 		 536 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.44 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  30.74 
 
 		 528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.81 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 524 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.03 
 
 		 456 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.79 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.79 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  24.88 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.38 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.33 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  24.79 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  27.05 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.59 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.31 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.68 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.2 
 
 		 505 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>