More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3418 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  71.74 
 
 		 468 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  71.49 
 
 		 457 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  71.71 
 
 		 457 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  78.29 
 
 		 456 aa  743    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 456 aa  934    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  72.87 
 
 		 460 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  71.52 
 
 		 459 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  71.74 
 
 		 460 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  70.24 
 
 		 463 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  72.02 
 
 		 461 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  69.58 
 
 		 463 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  48.47 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  45.24 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  45.02 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  37.5 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  41.52 
 
 		 466 aa  292  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  36.54 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  36.75 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.05 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  34.35 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  32.34 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  33.54 
 
 		 479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  35.17 
 
 		 500 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  33.12 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.57 
 
 		 465 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  33.71 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  32.79 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.3 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.39 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.63 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.6 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.97 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  31.54 
 
 		 498 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.45 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.45 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.11 
 
 		 565 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.03 
 
 		 551 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  30.88 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.92 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.79 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.82 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.66 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.45 
 
 		 592 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  28.16 
 
 		 508 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.22 
 
 		 551 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  30.19 
 
 		 489 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  24.6 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.52 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.37 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.45 
 
 		 490 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.87 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  31.89 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  25.06 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  26.97 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  29.44 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  24.58 
 
 		 705 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.56 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  23.68 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  24.66 
 
 		 594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  24.74 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.82 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  33.19 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  26.95 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  28.48 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  26.8 
 
 		 531 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.86 
 
 		 373 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.91 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.72 
 
 		 535 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.72 
 
 		 535 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.98 
 
 		 535 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  30.26 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  35 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  26.92 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.51 
 
 		 579 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  35 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  26.99 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  28.23 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  28.23 
 
 		 536 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  33.07 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  33.06 
 
 		 505 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  29.73 
 
 		 640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.51 
 
 		 551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  26.8 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  25.86 
 
 		 497 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  29.85 
 
 		 604 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  27.67 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  27.56 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  33.18 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>