More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3033 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
477 aa  969    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  53.59 
 
 
478 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  50.12 
 
 
511 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  59.54 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  39.84 
 
 
508 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  39.21 
 
 
498 aa  292  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  39.96 
 
 
521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  39.73 
 
 
521 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  37.95 
 
 
536 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  37.66 
 
 
551 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  40.09 
 
 
489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  38.75 
 
 
513 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  32.35 
 
 
554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  32.35 
 
 
554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  31.72 
 
 
546 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  31.65 
 
 
544 aa  259  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  33.77 
 
 
527 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.8 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  30.37 
 
 
551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.8 
 
 
549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  35.77 
 
 
504 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.74 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.74 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  37.78 
 
 
506 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  36.36 
 
 
521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  34.74 
 
 
518 aa  240  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  34.52 
 
 
518 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  29.88 
 
 
568 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  29.14 
 
 
568 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  29.71 
 
 
568 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  30 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  31.77 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  31.34 
 
 
513 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.42 
 
 
565 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  30.98 
 
 
515 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  29.15 
 
 
705 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  29.59 
 
 
561 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  32.65 
 
 
504 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  31.1 
 
 
456 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  28.32 
 
 
566 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  32.88 
 
 
476 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  27.07 
 
 
803 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 
483 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  32.56 
 
 
497 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 
464 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 
464 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 
499 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  34.04 
 
 
601 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  33.73 
 
 
601 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  30.96 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  35.47 
 
 
621 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  28.69 
 
 
463 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.23 
 
 
638 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  29.1 
 
 
463 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  32.6 
 
 
592 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.16 
 
 
460 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  29.38 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  28.63 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  37.64 
 
 
611 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  36.06 
 
 
656 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.1 
 
 
460 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.19 
 
 
457 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 
457 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.57 
 
 
607 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  29.4 
 
 
460 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  35.96 
 
 
637 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  28.64 
 
 
460 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  28.42 
 
 
460 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  33.43 
 
 
673 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  28.31 
 
 
463 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  30.23 
 
 
664 aa  156  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  34.08 
 
 
604 aa  156  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.34 
 
 
621 aa  156  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  29.74 
 
 
561 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  33.21 
 
 
580 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  30.09 
 
 
666 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  30.48 
 
 
465 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  32.84 
 
 
619 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.45 
 
 
664 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  29.05 
 
 
502 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  30.95 
 
 
434 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  30.95 
 
 
434 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  27.15 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  34.89 
 
 
680 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  32.52 
 
 
605 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  35.07 
 
 
627 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  33.21 
 
 
605 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  34.66 
 
 
569 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  33.57 
 
 
606 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  32.46 
 
 
652 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  32.46 
 
 
652 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  32.84 
 
 
604 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  32.34 
 
 
671 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  33.96 
 
 
659 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  31.58 
 
 
642 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  31.58 
 
 
672 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  27.77 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  33.99 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.25 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>