More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3596 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 434 aa  887    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 434 aa  887    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  40.85 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  39 
 
 		 464 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  39 
 
 		 464 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.79 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.84 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.65 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.86 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 466 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.92 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.02 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.33 
 
 		 463 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  32.25 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  32.09 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  31 
 
 		 459 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  32.94 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  32.71 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  32.39 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.4 
 
 		 511 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  30.54 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.57 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.18 
 
 		 544 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.29 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  29.68 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  34.23 
 
 		 479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  34.47 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  30.75 
 
 		 551 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  33.25 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  30.92 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  34.94 
 
 		 592 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.23 
 
 		 535 aa  162  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  31.92 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  32.62 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 		 498 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  30.95 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.45 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  25.59 
 
 		 705 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  28.49 
 
 		 506 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 		 373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  29.74 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  27.33 
 
 		 508 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.11 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.95 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  30.26 
 
 		 535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.07 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 533 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  28.81 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.37 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.37 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  30.26 
 
 		 535 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  28.84 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  26.53 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.83 
 
 		 551 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25.32 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.22 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.27 
 
 		 536 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  31.6 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.27 
 
 		 536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  26.99 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  37.78 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  28.28 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.87 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.58 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  26.63 
 
 		 624 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 515 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  37.22 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  40.37 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  37.22 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  42.55 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  42.55 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  26.93 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  40.37 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  28.18 
 
 		 627 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.07 
 
 		 519 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 591 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.87 
 
 		 513 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  34.71 
 
 		 640 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  23.93 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  30.67 
 
 		 358 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.02 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  28.53 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.6 
 
 		 547 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.63 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.45 
 
 		 536 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  29.19 
 
 		 626 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  32.89 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  37.35 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>