More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7403 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  83.3 
 
 		 478 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 465 aa  907    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  70.02 
 
 		 498 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  64.09 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  67.44 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  63.66 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  42.49 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  44.63 
 
 		 466 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  37.5 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  37.55 
 
 		 476 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.96 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.96 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.46 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  33.57 
 
 		 456 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.56 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.23 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.38 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  32.06 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.41 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.82 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  33.87 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  33.11 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  33.05 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.22 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  33.05 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 463 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  31.62 
 
 		 468 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  34.47 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  35.32 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  31.14 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  30.91 
 
 		 459 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.37 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  35.07 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  35.48 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  34.9 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.57 
 
 		 527 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.54 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  26.11 
 
 		 565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  30.46 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.65 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.51 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.12 
 
 		 478 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.98 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.69 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.62 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 551 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 551 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.47 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.93 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.93 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.39 
 
 		 508 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  27.51 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  33.25 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  29.25 
 
 		 511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  28.39 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.16 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  24.43 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.31 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.02 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.4 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.73 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.4 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.97 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.4 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  28.29 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.26 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  25.57 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  23.7 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  25.76 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.37 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.52 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  24.54 
 
 		 533 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  29.24 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  29.8 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.93 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.93 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 		 579 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  25.56 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  29.24 
 
 		 534 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.7 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  31.65 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  31.65 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  31.65 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  31.65 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  31.65 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.7 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.7 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.7 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  25.93 
 
 		 551 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.7 
 
 		 586 aa  99.8  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  24.54 
 
 		 533 aa  99.8  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  26.74 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  25.81 
 
 		 373 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  32.5 
 
 		 556 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>