More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2414 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 479 aa  949    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  98.12 
 
 		 479 aa  931    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  87.68 
 
 		 500 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  66.74 
 
 		 498 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  64.48 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  65.9 
 
 		 478 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  41.26 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  41.68 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  37.74 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  35.21 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  33.94 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  33.94 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.22 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 437 aa  200  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.2 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  34.26 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  31.3 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  32.5 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.99 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  30.56 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  35.46 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  30.32 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  34.22 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  34.04 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  31.5 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.88 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  30.33 
 
 		 460 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  34.32 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  31.58 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  32.29 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.43 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  30.66 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.43 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  31.45 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  30.13 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  30.02 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  33.83 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.36 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.57 
 
 		 527 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.39 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.32 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  25.19 
 
 		 565 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.09 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.95 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  26.58 
 
 		 508 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.42 
 
 		 549 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  24.42 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  24.42 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  31.52 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  23.8 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.36 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  23.8 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  25.97 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.53 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.06 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.06 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 586 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.92 
 
 		 592 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 536 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 536 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  25.6 
 
 		 521 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 536 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  24.26 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  23.12 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.11 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  26.76 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  26.69 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  29.31 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.84 
 
 		 535 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.84 
 
 		 535 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.7 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  28.63 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  25.42 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  26.22 
 
 		 521 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  26.09 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  26.09 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  25.69 
 
 		 664 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  30.27 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.09 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.03 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.4 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  27.95 
 
 		 672 aa  100  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  27.95 
 
 		 642 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  23.35 
 
 		 513 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  28.94 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  27.61 
 
 		 657 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  23.11 
 
 		 705 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.17 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  32.58 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  28.18 
 
 		 627 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  28.87 
 
 		 621 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  27.2 
 
 		 601 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  25.78 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  25.95 
 
 		 506 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>