More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2369 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 500 aa  983    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  87.68 
 
 		 479 aa  823    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  88.52 
 
 		 479 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  68.37 
 
 		 498 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  66.52 
 
 		 465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  66.82 
 
 		 478 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  41.39 
 
 		 508 aa  349  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  43.58 
 
 		 466 aa  334  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.86 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  36.41 
 
 		 446 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.21 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  33.33 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  34.57 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  34.57 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  34.88 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  33.26 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.24 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  32.14 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  31.68 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  32.37 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.99 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  35.17 
 
 		 456 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  32.15 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.56 
 
 		 456 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  33.19 
 
 		 463 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  35.48 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  33.13 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 		 457 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  31.36 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  36.01 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  31.51 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  35.67 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.81 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  35.14 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  33.12 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  33.12 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  32.99 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  32.02 
 
 		 436 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.25 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  29.18 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  26.37 
 
 		 565 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.11 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.88 
 
 		 546 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.54 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.2 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.88 
 
 		 544 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 549 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.83 
 
 		 551 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.83 
 
 		 551 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.44 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.08 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.44 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  24.71 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  31.43 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  27.02 
 
 		 521 aa  117  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.02 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.24 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  26.76 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.86 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  28.6 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  26.81 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.87 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.24 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  28.42 
 
 		 536 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  28.42 
 
 		 536 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.07 
 
 		 592 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.5 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.5 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  29.19 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.81 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.54 
 
 		 535 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.84 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  25.9 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.95 
 
 		 533 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.4 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.62 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  24.18 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  26.67 
 
 		 524 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.77 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.69 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.98 
 
 		 358 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  31.92 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  23.34 
 
 		 705 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  24.71 
 
 		 594 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  35.93 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  26.65 
 
 		 664 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.26 
 
 		 358 aa  94  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  28.7 
 
 		 627 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.61 
 
 		 373 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 515 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  28.23 
 
 		 633 aa  90.5  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>