107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4576 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  838    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  50.61 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  49.33 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  48.42 
 
 		 440 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 		 442 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  45.72 
 
 		 446 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  45.02 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  35.31 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.22 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.24 
 
 		 500 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  34.83 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  30.13 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  32.2 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  33.61 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  26.21 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  28.79 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.63 
 
 		 466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.32 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  25.32 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  27.17 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  26.3 
 
 		 476 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  25.6 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  25.6 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  23.68 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  25.74 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  24.3 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  26.33 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  23.1 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  23.34 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.65 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  23.34 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  26.43 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  24.72 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  24.78 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  25.85 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  22.79 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  22.47 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  22.2 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  22.2 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  26.34 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  26.55 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  26.55 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  24.81 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  21.12 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  20.75 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  20.62 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  25.27 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  26.49 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  24.18 
 
 		 464 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.15 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  23.28 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.29 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.29 
 
 		 536 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  26.93 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.57 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  23.84 
 
 		 534 aa  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.2 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  20.04 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.88 
 
 		 533 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  24.82 
 
 		 524 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.04 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.75 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  26.59 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.88 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  26.42 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.03 
 
 		 591 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  22.86 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  23.89 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 		 565 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  24.4 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  24.4 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  25.28 
 
 		 512 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  24.03 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  28.04 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.7 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  27.42 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  25.47 
 
 		 592 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 		 579 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  21.07 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  27.42 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  25.32 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  25.77 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.29 
 
 		 533 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  27.42 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  23.61 
 
 		 528 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>