171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2390 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 441 aa  862    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  55.48 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  55.84 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  54.13 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  55.24 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  52.81 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  50.47 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  35.48 
 
 		 465 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  35.29 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  34.81 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  34.65 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  32.37 
 
 		 460 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  33.66 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  31.9 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.23 
 
 		 508 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.57 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  32.5 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  28.32 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  28.07 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  28.54 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.86 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.25 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.25 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.3 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.48 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  27.09 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.32 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  26.26 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  26.4 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  27.55 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  23.88 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  27.75 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  26.14 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  24.09 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  25.89 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  22.39 
 
 		 554 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  22.39 
 
 		 554 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  24.94 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  22 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  26.46 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  24.79 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  21.43 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  21.13 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  25.12 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  21.98 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  21.26 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  21.26 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.72 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  21.34 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  24.29 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  25.55 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  28.63 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  25.51 
 
 		 518 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  24.77 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.9 
 
 		 565 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.11 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  24.63 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  26.42 
 
 		 606 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.16 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  25.49 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  26.02 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  26.6 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  27.71 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  24.66 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  23.16 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  30 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  22.88 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  24.46 
 
 		 633 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  21.48 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  25.5 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  26.14 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  22.63 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  23.21 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  24.7 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  26.07 
 
 		 506 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  26.16 
 
 		 574 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  23.98 
 
 		 572 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  22.87 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  20.99 
 
 		 664 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  20.68 
 
 		 666 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  22.8 
 
 		 640 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  24.32 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  22.66 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  23.48 
 
 		 626 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  23.24 
 
 		 631 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  23.56 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  23.24 
 
 		 631 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  21.57 
 
 		 671 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  26.68 
 
 		 575 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  25.83 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  21.81 
 
 		 652 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  23.11 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  21.81 
 
 		 652 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  23.1 
 
 		 612 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>