More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3588 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 422 aa  816    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.57 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  28.01 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.32 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  32.5 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  31.63 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  27.17 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  32.27 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.59 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  32.69 
 
 		 441 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  32.68 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  31.97 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  31.52 
 
 		 479 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.1 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.27 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  29.21 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  32.11 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  31.33 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  30.92 
 
 		 425 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.61 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  26.5 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  28.17 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  25.94 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.5 
 
 		 592 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  27.46 
 
 		 456 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  27.69 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.29 
 
 		 476 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  24.46 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  25.56 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  23.45 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  23.89 
 
 		 460 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  26.9 
 
 		 470 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  27.7 
 
 		 466 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.5 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  28.5 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.56 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.78 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  26.78 
 
 		 478 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  25.96 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  25.96 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  29.19 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  31.11 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.87 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  29.1 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  30.86 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  29.1 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.51 
 
 		 544 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.89 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  31.35 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  31.22 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  34.19 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  34.19 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  31.22 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  34.19 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  26.8 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  30.41 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  29.35 
 
 		 656 aa  77.4  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.9 
 
 		 499 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  26.87 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  27.6 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  24.82 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  24.04 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  29.57 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  30.07 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  30.27 
 
 		 589 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.05 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  31.52 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  22.04 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  32.02 
 
 		 598 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  29.51 
 
 		 621 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  27.87 
 
 		 673 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  36.75 
 
 		 551 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.72 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  28.49 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  29.24 
 
 		 604 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.1 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  28.11 
 
 		 604 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  29.41 
 
 		 574 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  28.49 
 
 		 664 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  34.57 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  32.08 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  29.81 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  30.48 
 
 		 600 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  28.65 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  27.57 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  28.65 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  25 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  29.71 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  22.4 
 
 		 638 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  31.37 
 
 		 579 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  28.12 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  28.73 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.39 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  30.18 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  29.81 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>