More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2221 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  59.41 
 
 		 611 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  64.21 
 
 		 584 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  59.23 
 
 		 594 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  69.08 
 
 		 590 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  67.75 
 
 		 593 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  100 
 
 		 563 aa  1141    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  66.6 
 
 		 556 aa  705    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  54.16 
 
 		 637 aa  631  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  49.34 
 
 		 621 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  50.98 
 
 		 604 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  49.37 
 
 		 601 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  49.37 
 
 		 601 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  48.39 
 
 		 592 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  51.99 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  47.62 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  49.5 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  47.52 
 
 		 580 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  45.6 
 
 		 605 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  46.17 
 
 		 604 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  46.1 
 
 		 605 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  45.9 
 
 		 606 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  48.08 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  44.32 
 
 		 619 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  46.49 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  44.57 
 
 		 621 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  47.24 
 
 		 606 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  44.62 
 
 		 656 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  46.17 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  50.1 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  51.33 
 
 		 569 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  45.45 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  45.8 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  46.83 
 
 		 594 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  46.01 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  45.75 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  48.32 
 
 		 599 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  44.97 
 
 		 606 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  44.3 
 
 		 606 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  42.12 
 
 		 642 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  45.31 
 
 		 626 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  46.47 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  45.73 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  44.79 
 
 		 598 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  45.73 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  42.83 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  42.86 
 
 		 627 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  43.4 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  43.11 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  42.86 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  43.9 
 
 		 605 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  45.99 
 
 		 564 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  44 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  41.99 
 
 		 612 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  55.08 
 
 		 638 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  49.61 
 
 		 652 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  49.61 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  49.61 
 
 		 652 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  50.13 
 
 		 669 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  55.52 
 
 		 680 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  48.62 
 
 		 673 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  49.86 
 
 		 664 aa  352  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  47.68 
 
 		 657 aa  349  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  50.14 
 
 		 630 aa  339  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  50.42 
 
 		 633 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  47.19 
 
 		 672 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  44.17 
 
 		 664 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  44.1 
 
 		 666 aa  326  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  46.8 
 
 		 640 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  37.18 
 
 		 809 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  35.84 
 
 		 871 aa  310  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  35.56 
 
 		 746 aa  306  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  36.38 
 
 		 803 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  47.52 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  47.52 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  36.69 
 
 		 705 aa  294  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  34.71 
 
 		 511 aa  243  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1064 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  31.72 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  39.04 
 
 		 946 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  40.54 
 
 		 941 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.9 
 
 		 498 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.57 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  32.52 
 
 		 513 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  29.63 
 
 		 497 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  27.95 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.05 
 
 		 565 aa  163  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.05 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 499 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  26.97 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  27.96 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  34.51 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  26.45 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  33.85 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  37.19 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  33.02 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  33.02 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  26.36 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  31.4 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  31.69 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  34.47 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>