More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2631 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  63.16 
 
 
611 aa  754    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  63.78 
 
 
563 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  63.75 
 
 
584 aa  718    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  60.56 
 
 
594 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  60.27 
 
 
590 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  59.63 
 
 
593 aa  693    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  100 
 
 
556 aa  1139    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  53.09 
 
 
637 aa  628  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  50.61 
 
 
604 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  46.22 
 
 
601 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  51.93 
 
 
579 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  48.7 
 
 
621 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  46.55 
 
 
601 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  46.54 
 
 
605 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  47.34 
 
 
589 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  48.76 
 
 
592 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  48.64 
 
 
630 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  46.64 
 
 
606 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  45.85 
 
 
604 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  48.74 
 
 
561 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  45.41 
 
 
619 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  46.48 
 
 
580 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  47.87 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  46.37 
 
 
605 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  48.26 
 
 
572 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  45.57 
 
 
621 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  47.23 
 
 
606 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  46.6 
 
 
574 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  46.3 
 
 
607 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  46.83 
 
 
659 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  46.22 
 
 
561 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  49.36 
 
 
569 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  44.88 
 
 
598 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  45.7 
 
 
594 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  45.67 
 
 
626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  42.4 
 
 
642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  45.39 
 
 
605 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  41.39 
 
 
656 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  42.16 
 
 
614 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  43.65 
 
 
605 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  41.07 
 
 
657 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  42.54 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  43.4 
 
 
602 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  43.41 
 
 
606 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  43.5 
 
 
606 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  42.14 
 
 
627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  42.37 
 
 
631 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  42.37 
 
 
631 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  42.38 
 
 
612 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  42.53 
 
 
564 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  41.35 
 
 
581 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  42.81 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  44.08 
 
 
600 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  42.63 
 
 
568 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  45.94 
 
 
599 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  41.67 
 
 
568 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  52.66 
 
 
638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  48.76 
 
 
673 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  50.68 
 
 
669 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  49.59 
 
 
652 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  49.59 
 
 
671 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  49.59 
 
 
652 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  48.28 
 
 
664 aa  352  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  52.99 
 
 
680 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  46.24 
 
 
672 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  47.73 
 
 
633 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  43.46 
 
 
664 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  47.16 
 
 
630 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  44.05 
 
 
666 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  34.82 
 
 
809 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  33.21 
 
 
803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  34.66 
 
 
746 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  34.68 
 
 
705 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  32.29 
 
 
871 aa  269  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.95 
 
 
511 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  32.21 
 
 
521 aa  219  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  31.84 
 
 
521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.75 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  34.81 
 
 
1064 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.42 
 
 
498 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  37.91 
 
 
946 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  37.84 
 
 
941 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.14 
 
 
527 aa  193  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.4 
 
 
508 aa  190  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.68 
 
 
546 aa  189  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.37 
 
 
565 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  32.35 
 
 
536 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.94 
 
 
549 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  27.15 
 
 
551 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  27.15 
 
 
551 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.48 
 
 
546 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.2 
 
 
554 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.2 
 
 
554 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.39 
 
 
551 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.71 
 
 
551 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.1 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  29.49 
 
 
497 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 
499 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  35.12 
 
 
521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>