More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0108 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  61.06 
 
 		 605 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  61.49 
 
 		 574 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  55.54 
 
 		 669 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  60.27 
 
 		 589 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  58.82 
 
 		 619 aa  740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  60.87 
 
 		 580 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  60.1 
 
 		 606 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  62.1 
 
 		 592 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  60.98 
 
 		 572 aa  703    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  67.21 
 
 		 600 aa  811    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  61.2 
 
 		 621 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  57.76 
 
 		 652 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  60.64 
 
 		 566 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  57.76 
 
 		 671 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  100 
 
 		 606 aa  1240    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  59.46 
 
 		 607 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  58.74 
 
 		 605 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  97.85 
 
 		 606 aa  1207    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  60.5 
 
 		 606 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  59.83 
 
 		 604 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  57.76 
 
 		 652 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  68.81 
 
 		 602 aa  845    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  54.59 
 
 		 594 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  52.91 
 
 		 626 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  54.24 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  52.22 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  51.66 
 
 		 630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  51.74 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  51.66 
 
 		 561 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  51.93 
 
 		 604 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  54.29 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  50.16 
 
 		 627 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  51.06 
 
 		 612 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  47.81 
 
 		 656 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  50.4 
 
 		 631 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  50.4 
 
 		 631 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  52.76 
 
 		 605 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  51.68 
 
 		 581 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  53.78 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  47.63 
 
 		 664 aa  558  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  46.58 
 
 		 657 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  47.29 
 
 		 642 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  44.76 
 
 		 664 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  44.63 
 
 		 666 aa  555  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  45.74 
 
 		 672 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  48.55 
 
 		 659 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  49.33 
 
 		 564 aa  547  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  48.5 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  43.56 
 
 		 601 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  43.88 
 
 		 601 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  43.77 
 
 		 638 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  46.12 
 
 		 621 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  47.85 
 
 		 604 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  46.84 
 
 		 637 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  43.48 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  42.67 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  42.97 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  45.34 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  45.49 
 
 		 569 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  45.13 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  44.97 
 
 		 563 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  43.87 
 
 		 584 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  43.58 
 
 		 590 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  43.57 
 
 		 593 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  43.22 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  43.71 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  43.52 
 
 		 599 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  55.98 
 
 		 640 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  47.61 
 
 		 673 aa  339  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  34.64 
 
 		 803 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  49.07 
 
 		 680 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  33.51 
 
 		 705 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  30.82 
 
 		 809 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  32.28 
 
 		 746 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  32.59 
 
 		 871 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1064 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  36.13 
 
 		 946 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  35.42 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  34.75 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  33.76 
 
 		 521 aa  147  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  32.83 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  34.8 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  33.24 
 
 		 518 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  33.24 
 
 		 518 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.94 
 
 		 521 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  32.89 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  33.22 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  32.81 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.37 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  30.45 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  31.51 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  30.23 
 
 		 546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.95 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 		 498 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.21 
 
 		 554 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.21 
 
 		 554 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  31.73 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.11 
 
 		 549 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  34.09 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>