More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0192 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
746 aa  1553    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  58.21 
 
 
705 aa  862    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  73.99 
 
 
871 aa  1147    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  37.57 
 
 
809 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  35.37 
 
 
563 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  34.34 
 
 
605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  34.9 
 
 
605 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  35.22 
 
 
606 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  35.23 
 
 
579 aa  304  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  33.45 
 
 
601 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  35.98 
 
 
574 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  34.03 
 
 
619 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  35.2 
 
 
566 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  33.11 
 
 
601 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  35.78 
 
 
572 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  38.8 
 
 
946 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  34.63 
 
 
607 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  36 
 
 
593 aa  300  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  33.69 
 
 
580 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  33.92 
 
 
803 aa  296  9e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  36.14 
 
 
604 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.44 
 
 
638 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  32.37 
 
 
584 aa  294  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  34.22 
 
 
590 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  33.62 
 
 
637 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  34.04 
 
 
604 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  33.98 
 
 
589 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  35.1 
 
 
594 aa  290  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.93 
 
 
621 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.45 
 
 
606 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  33.33 
 
 
630 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.11 
 
 
592 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  38.65 
 
 
941 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  31.7 
 
 
671 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  31.7 
 
 
652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  31.7 
 
 
652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  34.84 
 
 
599 aa  285  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  33.52 
 
 
594 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  34.69 
 
 
561 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  35 
 
 
561 aa  280  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  34.04 
 
 
664 aa  280  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  34.14 
 
 
666 aa  280  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  33.93 
 
 
664 aa  278  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  32.05 
 
 
621 aa  278  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  32.91 
 
 
598 aa  276  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  35.27 
 
 
556 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  34 
 
 
642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  34.05 
 
 
657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  32.3 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  33.98 
 
 
569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  34.89 
 
 
568 aa  275  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  31.35 
 
 
626 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  35.24 
 
 
611 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  31.94 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
630 aa  270  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  32.32 
 
 
605 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  33.77 
 
 
568 aa  267  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  32.68 
 
 
606 aa  266  8e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  31.64 
 
 
633 aa  265  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  31.9 
 
 
627 aa  264  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  32.09 
 
 
614 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  34.7 
 
 
568 aa  264  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  31.69 
 
 
659 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  32.23 
 
 
602 aa  262  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  31.7 
 
 
606 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  33.39 
 
 
604 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  33.33 
 
 
605 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  31.45 
 
 
612 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  30.83 
 
 
631 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  30.83 
 
 
631 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  31.76 
 
 
564 aa  251  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.62 
 
 
656 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  36.13 
 
 
669 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  39.32 
 
 
672 aa  214  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  33.33 
 
 
1064 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  32.37 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  36.01 
 
 
640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  32.98 
 
 
673 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  26.11 
 
 
504 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  27.08 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 
477 aa  160  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.94 
 
 
489 aa  144  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31 
 
 
498 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  29.68 
 
 
513 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 
565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  32.37 
 
 
504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.75 
 
 
506 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  28.52 
 
 
483 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  33.84 
 
 
478 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  28.9 
 
 
511 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  30.69 
 
 
513 aa  121  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.05 
 
 
521 aa  120  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  28.31 
 
 
521 aa  119  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.86 
 
 
521 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  29.23 
 
 
518 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  29.28 
 
 
518 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  29.93 
 
 
570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  23.43 
 
 
437 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 
463 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  25.34 
 
 
463 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>